RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 LPOP22079 712 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 LIMK2P53671 638 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 SEL1L2Q5TEA6 688 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 DTX3LQ8TDB6 740 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 HES6Q96HZ4 224 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 TBL1YQ9BQ87 522 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 GORASP1Q9BQQ3 440 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 CPNE7Q9UBL6 633 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 A6NCN8 305 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 C5orf60A6NFR6 353 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 UGT1A9O60656 530 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 CRTAMO95727 393 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 UGT1A6P19224 532 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 IDSP22304 550 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 UGT1A1P22309 533 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 UGT1A4P22310 534 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 MPSTP25325 297 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 AKT1P31749 480 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 UGT1A3P35503 534 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 PDE1BQ01064 536 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 SQSTM1Q13501 440 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 RANBP10Q6VN20 620 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 EXD3Q8N9H8 876 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 OR4K2Q8NGD2 314 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 UGT1A7Q9HAW7 530 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 UGT1A10Q9HAW8 530 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 UGT1A8Q9HAW9 530 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 SLC23A2Q9UGH3 650 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 ACSL6Q9UKU0 697 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 NVLO15381 856 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 ARHGAP6O43182 974 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 PRAMEF1O95521 474 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 VIPP01282 170 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 CSF2RBP32927 897 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 ADRA1AP35348 466 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 EPHA4P54764 986 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 OLIG2Q13516 323 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 TGIF1Q15583 401 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 TMEM71Q6P5X7 295 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 AGBL5Q8NDL9 886 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 DDHD1Q8NEL9 900 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 NCSTNQ92542 709 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 USP7Q93009 1102 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 BSNQ9UPA5 3926 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 GPR39O43194 453 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 PRAMEF10O60809 474 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 MSH3P20585 1137 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 RPL10P27635 214 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 KCNC4Q03721 635 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 SPARCL1Q14515 664 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 PTPRCAPQ14761 206 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 PARP6Q2NL67 630 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 P3H1Q32P28 736 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 LINC00303Q3SY05 128 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 SNAP47Q5SQN1 464 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 GPRC6AQ5T6X5 926 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 ZNF547Q8IVP9 402 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 ZNF398Q8TD17 642 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 TMEM121Q9BTD3 319 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 TMEM9Q9P0T7 183 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 PTPN13Q12923 2485 aa21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NME4-201ENST00000219479 WISP1O95388 367 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 THRAP10827 490 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 ETV5P41161 510 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 HALP42357 657 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 NFATC3Q12968 1075 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 AMZ2Q86W34 360 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 FAM129CQ86XR2 697 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 CXorf40BQ96DE9 158 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 ALS2CR12Q96Q35 445 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 ASB8Q9H765 288 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 LRRC40Q9H9A6 602 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 SMOXQ9NWM0 555 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 FKBPLQ9UIM3 349 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa21.39■■□□□ 1.01
NME4-201ENST00000219479 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms