RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fam151b	D3YUE4	279 aa		27.55	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Il1a	P01582	270 aa		27.55	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Scg5	P12961	212 aa		27.55	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Crem	P27699	357 aa		27.55	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Znf800	Q0VEE6	662 aa		27.55	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Esrp1	Q3US41	680 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Clhc1	Q5M6W3	596 aa		27.55	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rbbp7	Q60973	425 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Timm29	Q8BGX2	266 aa		27.55	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355		Q8BWQ6	963 aa		27.55	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccdc70	Q9D9B0	223 aa		27.55	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nectin1	Q9JKF6	515 aa		27.55	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pld1	Q9Z280	1074 aa		27.55	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gpsm3	Q3U1Z5	159 aa		27.54	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slc22a15	Q504N2	544 aa		27.54	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zzz3	Q6KAQ7	910 aa		27.54	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gpr17	Q6NS65	339 aa		27.54	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Syt14	Q7TN84	555 aa		27.54	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sntn	Q8C9X1	147 aa		27.54	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cacnb2	Q8CC27	655 aa		27.54	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pcdhb4	Q91XZ6	784 aa		27.54	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mapk8	Q91Y86	384 aa		27.54	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ube4b	Q9ES00	1173 aa		27.54	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	St6galnac1	Q9QZ39	526 aa		27.54	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vmn1r49	Q9WUF1	310 aa		27.54	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	E2f3	O35261	457 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fzd1	O70421	642 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccnd1	P25322	295 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Grik2	P39087	908 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tgfbi	P82198	683 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cd6	Q61003	665 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Taf1c	Q6PDZ2	836 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kirrel1	Q80W68	789 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	B3galnt2	Q8BG28	504 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Prr11	Q8BHE0	368 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mtrf1l	Q8BJU9	373 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Camk1d	Q8BW96	385 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Denr	Q9CQJ6	198 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Capn10	Q9ESK3	666 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Smpd3	Q9JJY3	655 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tbk1	Q9WUN2	729 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Igkv5-39	A0A0G2JDV4	115 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Igkv12-98	A0A0G2JGF9	115 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zfp952	B0V2W4	504 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vmn2r118	E9Q1C1	853 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Jhy	E9Q793	770 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm8444	F6XS56	118 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slc22a2	O70577	553 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Inpp5j	P59644	1003 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Snx31	Q6P8Y7	439 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rexo4	Q6PAQ4	432 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pi4k2b	Q8CBQ5	469 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zfp940	Q8R2Q3	566 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cers2	Q924Z4	380 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dhdds	Q99KU1	333 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Snx2	Q9CWK8	519 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nrip2	Q9JHR9	270 aa		27.53	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pramef17	A2ASJ1	475 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Alox8	O35936	677 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cxcr3	O88410	367 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Csf3r	P40223	837 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slc16a1	P53986	493 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hesx1	Q61658	185 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bcl2l1	Q64373	233 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kirrel2	Q7TSU7	700 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zfyve1	Q810J8	777 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cxcr1	Q810W6	351 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ppp1r15b	Q8BFW3	697 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Epb41l5	Q8BGS1	731 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tyw3	Q8BSA9	257 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fndc3a	Q8BX90	1198 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vps26b	Q8C0E2	336 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Olfr606	Q8VGZ8	319 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Oas1c	Q924S2	362 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Yae1d1	Q9DAY6	216 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Csnk1d	Q9DC28	415 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Chek2	Q9Z265	546 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Igkv10-94	A0A075B5L1	115 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm12695	A2AGB2	545 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Socs5	O54928	536 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ghr	P16882	650 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gnao1	P18872	354 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Polr1b	P70700	1135 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	F8a1	Q00558	380 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tapt1	Q4VBD2	564 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Coq4	Q8BGB8	266 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lrrc8d	Q8BGR2	859 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Acsf2	Q8VCW8	615 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Olfr1019	Q8VGS3	310 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Usb1	Q91W78	267 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gcsh	Q91WK5	170 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fam162a	Q9D6U8	155 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gid8	Q9D7M1	228 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Glod5	Q9D8I3	148 aa		27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rpn2	Q9DBG6	631 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	4921501E09Rik	A0A0R4J054	908 aa		27.51	■■□□□ 1.99
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sod3	O09164	251 aa		27.51	■■□□□ 1.99
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myadml2	Q08AU7	307 aa		27.51	■■□□□ 1.99
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cog7	Q3UM29	770 aa		27.51	■■□□□ 1.99
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Arhgap30	Q640N3	1101 aa		27.51	■■□□□ 1.99

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