RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032962.10

Cln3-201, Transcript of Battenin, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cln3, Length 2,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3-201ENSMUST00000032962 Gabpb1Q00420 383 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 StyxQ60969 223 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 CcnhQ61458 323 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Otud6aQ6IE21 290 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Olfr366Q7TRY4 309 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Fnip2Q80TD3 1108 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Rbm22Q8BHS3 420 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Slc41a1Q8BJA2 512 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 TbcdQ8BYA0 1196 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Cdc26Q99JP4 85 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Mrpl14Q9D1I6 145 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Ubqln5Q9D4I8 510 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Kctd4Q9D7X1 259 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Cldn19Q9ET38 224 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 CtsrQ9JIA9 334 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Wdr49A0A0N4SUK7 710 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Cyp4f17G3UW78 524 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 AldoaP05064 364 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 PdgfrbP05622 1098 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Krt4P07744 525 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 F9P16294 471 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 CcnfP51944 777 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Zfp607aQ3TQG9 686 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Slfn4Q3UV66 602 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Suds3Q8BR65 328 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Prkaa2Q8BRK8 552 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Stx16Q8BVI5 326 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Ano4Q8C5H1 955 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 ThtpaQ8JZL3 224 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Gpr153Q8K0Z9 631 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Snrnp27Q8K194 155 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 FntbQ8K2I1 437 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 AdprmQ99KS6 340 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Rsl24d1Q99L28 163 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Cyp4f16Q99N17 524 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Chit1Q9D7Q1 464 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Znrf4Q9DAH2 327 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Ampd2Q9DBT5 798 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 EefsecQ9JHW4 583 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Habp4Q9JKS5 411 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Tbk1Q9WUN2 729 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 TectaO08523 2155 aa11.64□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Ttc23lA6H6E9 458 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Gm4847G3X946 537 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Olfr603L7N1Y4 312 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 DxoO70348 397 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Cdh1P09803 884 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 InhbcP55104 352 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Psme3P61290 254 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Pld2P97813 933 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Mc1rQ01727 315 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Cyb5r2Q3KNK3 276 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Micall2Q3TN34 1009 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Cog7Q3UM29 770 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Akap14Q3V0I7 536 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Fam189bQ5HZJ5 669 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Znrf3Q5SSZ7 913 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Itga7Q61738 1179 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Dlx3Q64205 287 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Dnajb13Q80Y75 316 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Adipor2Q8BQS5 386 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Usp43Q8BUM9 1132 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Zbtb49Q8BXX2 756 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Slc44a2Q8BY89 706 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Aqp12Q8CHJ2 290 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 ClyblQ8R4N0 338 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Olfr1325Q8VF43 315 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Olfr589Q8VGV8 317 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Cyp2c70Q91W64 489 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Reep3Q99KK1 254 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Mccc1Q99MR8 717 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Q9D937 123 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 PyglQ9ET01 850 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Il20Q9JKV9 176 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Cacna1eQ61290 2272 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Ttll11A4Q9F4 727 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Gm43302L7N1X8 611 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 C4bpaP08607 469 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Uba1yP31254 1058 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Ephx2P34914 554 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 St14P56677 855 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Htr4P97288 388 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Tmem184cQ3TPR7 525 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Fam160a1Q505K2 1081 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Pla2g4dQ50L43 825 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Gm5431Q5NCB3 844 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 JrkQ60976 557 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Smad2Q62432 467 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Klhl23Q6GQU2 558 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Rexo4Q6PAQ4 432 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Sarm1Q6PDS3 724 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 SvopQ8BFT9 548 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Mpp7Q8BVD5 576 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Ccdc187Q8C5V8 958 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Gbp5Q8CFB4 590 aa11.63□□□□□ -0.55
Cln3-201ENSMUST00000032962 Ttc39cQ8VE09 580 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.8 ms