RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	BBS4	Q96RK4	519 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	RAB20	Q9NX57	234 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	DIP2B	Q9P265	1576 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ASXL2	Q76L83	1435 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF263	O14978	683 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	CA12	O43570	354 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	NDUFS3	O75489	264 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	SOAT2	O75908	522 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	CTDNEP1	O95476	244 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	HBQ1	P09105	142 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	JUP	P14923	745 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	PRKAA2	P54646	552 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	MC1R	Q01726	317 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	BNIP2	Q12982	314 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	PRKAA1	Q13131	559 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	FADD	Q13158	208 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	MTMR2	Q13614	643 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	BTBD16	Q32M84	506 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	INAVA	Q3KP66	663 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	CHST3	Q7LGC8	479 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	SZRD1	Q7Z422	152 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	PDPR	Q8NCN5	879 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	SETD9	Q8NE22	299 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	PHF21B	Q96EK2	531 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	SPATA13	Q96N96	652 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	NACC1	Q96RE7	527 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ADGRL1	O94910	1474 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC182	A6NF36	153 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072		M0R2N6	131 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	UBE2C	O00762	179 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	HCRTR2	O43614	444 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	VEGFD	O43915	354 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	LTF	P02788	710 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	YES1	P07947	543 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	SERPINF2	P08697	491 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF806	P0C7X5	589 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ARNT	P27540	789 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ACOT2	P49753	483 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	PSMC6	P62333	389 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	CLC	Q05315	142 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	SLA	Q13239	276 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC142	Q17RM4	750 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	TOR2A	Q5JU69	321 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	CENPU	Q71F23	418 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	TRIL	Q7L0X0	811 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM122B	Q7Z309	247 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	GTF2H4	Q92759	462 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	USP7	Q93009	1102 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	OSMR	Q99650	979 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NECAP1-222	ENST00000640072	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		6.11	□□□□□ -1.43

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