RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628742.2

SOX9-AS1-218, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 733 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCM1Q15154 2024 aa6.65□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 AGRPO00253 132 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 INPP4BO15327 924 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LRCH4O75427 683 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KIAA0754O94854 1291 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 UBXN7O94888 489 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 JCHAINP01591 159 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FBXO45P0C2W1 286 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RORAP35398 523 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCK1P35558 622 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GPR1P46091 355 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SPINT3P49223 89 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CDH6P55285 790 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DMPKQ09013 629 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PTPRRQ15256 657 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CPZQ66K79 652 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C16orf46Q6P387 395 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 D2HGDHQ8N465 521 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR8K5Q8NH50 307 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 UBXN4Q92575 508 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TADA1Q96BN2 335 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 EID2BQ96D98 161 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MCEEQ96PE7 176 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR6C1Q96RD1 312 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CD180Q99467 661 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ING2Q9H160 280 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 VPS16Q9H269 839 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PIPSLA2A3N6 862 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CDC14CA4D256 554 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 A8MU76 341 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 A8MX80 341 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GRID2O43424 1007 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DPM1O60762 260 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GFPT2O94808 682 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PRF1P14222 555 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 IL4RP24394 825 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 COL8A1P27658 744 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MIPP30301 263 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NFATC2Q13469 925 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MED25Q71SY5 747 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TRIM74Q86UV6 250 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RSC1A1Q92681 617 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 AGAP3Q96P47 875 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TSGA13Q96PP4 275 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RANBP9Q96S59 729 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NLNQ9BYT8 704 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms