RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLON5A6NGN9 336 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 TM7SF2O76062 418 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 VIMP08670 466 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 CD1DP15813 335 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 BGNP21810 368 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 TECRLQ5HYJ1 363 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 LDLRAP1Q5SW96 308 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 KLC3Q6P597 504 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZS52 159 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 USP30Q70CQ3 517 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM42Q8IWZ5 723 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 RABEP2Q9H5N1 569 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 FZD4Q9ULV1 537 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 KLF11O14901 512 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFV2P19404 249 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 DRD4P21917 467 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 TARSP26639 723 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 STARD6P59095 220 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 KBTBD6Q86V97 674 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 DCUN1D1Q96GG9 259 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 CCT8L2Q96SF2 557 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 DERL2Q9GZP9 239 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 LATS2Q9NRM7 1088 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP99D6REC4 459 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 K7ESM1 405 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM107AO95990 144 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 RBP1P09455 135 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 NEFHP12036 1026 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNA4P22459 653 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 AKT1P31749 480 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 ZYG11AQ6WRX3 759 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 ISCA2Q86U28 154 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf107Q8IVU9 208 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 OR14C36Q8NHC7 312 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 BCAS4Q8TDM0 211 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 INPP5DQ92835 1189 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 LMAN1LQ9HAT1 526 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 THEGQ9P2T0 379 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 MTX2O75431 263 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN12O95859 305 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 OR56A5P0C7T3 313 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 RALBP11234 206 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 GABRG2P18507 467 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 TFEBP19484 476 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 MSH3P20585 1137 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR1P46091 355 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 ADPRHP54922 357 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC32Q14392 662 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 CHI3L2Q15782 390 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 SEL1L3Q68CR1 1132 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 RAET1GQ6H3X3 334 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 SHDQ96IW2 340 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 PANX3Q96QZ0 392 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 LTB4R2Q9NPC1 389 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB14O43829 449 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 AP2A2O94973 939 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM16O95361 564 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 MYL2P10916 166 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ACADMP11310 421 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 IL2P60568 153 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6V0D1P61421 351 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS21P63220 83 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 FZD5Q13467 585 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 CPNE9Q8IYJ1 553 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 PTERQ96BW5 349 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXL21Q9UKT6 434 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 KANSL1LA0AUZ9 987 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 INPP4BO15327 924 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 SGTAO43765 313 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGB6P18564 788 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM259Q4ZIN3 620 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 SYT13Q7L8C5 426 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 CPLX4Q7Z7G2 160 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa24.56■■□□□ 1.52
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