RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCDC154A6NI56 674 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 BTN3A1O00481 513 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRMUO75648 421 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ESR1P03372 595 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RHOCP08134 193 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CHRM3P20309 590 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 IL12AP29459 219 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 MC4RP32245 332 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RFC2P35250 354 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PTGER3P43115 390 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TM4SF4P48230 202 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC11A1P49279 550 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 AGTR2P50052 363 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACLYP53396 1101 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARPP19P56211 112 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 IL2P60568 153 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 UFM1P61960 85 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ECT2LQ008S8 904 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SREBF2Q12772 1141 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 MERTKQ12866 999 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RBBP7Q16576 425 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SMU1Q2TAY7 513 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZBED5Q49AG3 693 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 C6orf136Q5SQH8 315 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 UGT3A1Q6NUS8 523 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 FUT10Q6P4F1 479 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ISLR2Q6UXK2 745 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 FKBP9P1Q75LS8 142 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZFAND4Q86XD8 727 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PIANPQ8IYJ0 282 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 STK40Q8N2I9 435 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM47BQ8NA70 645 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 LEMD2Q8NC56 503 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR2T11Q8NH01 316 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CD200R1Q8TD46 325 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SEPT8Q92599 483 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCNJ9Q92806 393 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 LINGO1Q96FE5 620 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CASD1Q96PB1 797 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM175Q9BSA9 504 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SPON2Q9BUD6 331 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ADI1Q9BV57 179 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ADGRE3Q9BY15 652 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 P2RY12Q9H244 342 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ALG2Q9H553 416 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SMOXQ9NWM0 555 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PHF24Q9UPV7 400 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 AURKCQ9UQB9 309 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM50BQ9Y247 325 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 DHRS7Q9Y394 339 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACTL7AQ9Y615 435 aa9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 C9JVG2 144 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 E2F3O00716 465 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ENPP3O14638 875 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 STX7O15400 261 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 NIPSNAP2O75323 286 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR4F21O95013 312 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 C1RP00736 705 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ALDH2P05091 517 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATF6P18850 670 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 OXTRP30559 389 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CAPGP40121 348 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SCNN1BP51168 640 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 APLP1P51693 650 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 HPCAP84074 193 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRAF2Q12933 501 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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