RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617712.1

AC242842.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC242842.1, Length 447 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC242842.1-201ENST00000617712 PTPRRQ15256 657 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 DPYSL2Q16555 572 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 DPCR1Q3MIW9 517 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 PDPK2PQ6A1A2 396 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 WASH2PQ6VEQ5 465 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 POLNQ7Z5Q5 900 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 TMEM126BQ8IUX1 230 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 TEX26Q8N6G2 289 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 LPCAT1Q8NF37 534 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 RNF31Q96EP0 1072 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 SGSM3Q96HU1 749 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 IP6K3Q96PC2 410 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 LYSMD1Q96S90 227 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 MFRPQ9BY79 579 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 FANCEQ9HB96 536 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 SLC40A1Q9NP59 571 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 KCND1Q9NSA2 647 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 GPR83Q9NYM4 423 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 OGFRQ9NZT2 677 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 C5AR2Q9P296 337 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 SRPK3Q9UPE1 567 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 SIK3Q9Y2K2 1263 aa10.65□□□□□ -0.7
AC242842.1-201ENST00000617712 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 FLNCQ14315 2725 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 A0A0U1RQS6 177 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 ANKUB1A6NFN9 424 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 WIPF3A6NGB9 483 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 A6NL46 340 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 ANKRD66B4E2M5 251 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 MATN3O15232 486 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 SCRG1O75711 98 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 TMEM63AO94886 807 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 PEX11BO96011 259 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 JCHAINP01591 159 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 FTLP02792 175 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 RAB40ALP0C0E4 278 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 MYBL1P10243 752 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 COL8A1P27658 744 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 PLCL1Q15111 1095 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 KRT31Q15323 416 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 AGAP9Q5VTM2 703 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 TICAM1Q8IUC6 712 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 BRSK1Q8TDC3 778 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 CSPG4P5Q96PW8 444 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 PEBP4Q96S96 227 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 TIMM29Q9BSF4 260 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 LRP4O75096 1905 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 ICE1Q9Y2F5 2266 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 TEX15Q9BXT5 2789 aa10.64□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 FADS2P1A8MWK0 482 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 IPO13O94829 963 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 LDLRP01130 860 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 CD63P08962 238 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 GZMAP12544 262 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 MX2P20592 715 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 FECHP22830 423 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 CCNCP24863 283 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 SSR1P43307 286 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 VAV2P52735 878 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 TUBB4BP68371 445 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 ADCY2Q08462 1091 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 CHAF1BQ13112 559 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 TUBB2AQ13885 445 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 GPR18Q14330 331 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 NR6A1Q15406 480 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 KYNUQ16719 465 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 HADHQ16836 314 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 IZUMO3Q5VZ72 239 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 CRTC3Q6UUV7 619 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 RAB43Q86YS6 212 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 MAP7D3Q8IWC1 876 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 TRAM1L1Q8N609 369 aa10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
AC242842.1-201ENST00000617712 FDCSPQ8NFU4 85 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms