RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 ACOX3O15254 700 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 INPP4BO15327 924 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 TBX1O43435 398 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 PDE9AO76083 593 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 UMPSP11172 480 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 NCAM1P13591 858 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 FOSL1P15407 271 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 GSTM2P28161 218 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 NUDT1P36639 197 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 P2RX3P56373 397 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 GBE1Q04446 702 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 ANO4Q32M45 955 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 IDO2Q6ZQW0 420 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 SLC51BQ86UW2 128 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 OR8H2Q8N162 312 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 FAM109AQ8N4B1 249 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 LSMEM1Q8N8F7 131 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 SLC45A3Q96JT2 553 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 SENP8Q96LD8 212 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 NODALQ96S42 347 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 CENPOQ9BU64 300 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 NANOGQ9H9S0 305 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 C12orf10Q9HB07 376 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 NMRAL1Q9HBL8 299 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 PDE10AQ9Y233 779 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 KRT87PA6NCN2 255 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 A8MU76 341 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 PTGES3LE9PB15 166 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 GSTA4O15217 222 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 WDR47O94967 919 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 SEMA3DO95025 777 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 LTFP02788 710 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 PFKMP08237 780 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 GOT1P17174 413 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 ADRA1BP35368 520 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 MS4A2Q01362 244 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 DLG2Q15700 870 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 ESX1Q8N693 406 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF781Q8N8C0 355 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 TP53INP1Q96A56 240 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 ZUFSPQ96AP4 578 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 HDAC11Q96DB2 347 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 TMCO6Q96DC7 493 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 VMP1Q96GC9 406 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 B3GALT6Q96L58 329 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 SLC29A1Q99808 456 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 UQCC2Q9BRT2 126 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 DTLQ9NZJ0 730 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 NUP50Q9UKX7 468 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 VANGL2Q9ULK5 521 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 PCDHGB4Q9UN71 923 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 KLHL20Q9Y2M5 609 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 NDUFAF1Q9Y375 327 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 RWDD3Q9Y3V2 267 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 BBIP1A8MTZ0 92 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 MGAT1P26572 445 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 INPP1P49441 399 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 GEMP55040 296 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 LILRA4P59901 499 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 CHRNB3Q05901 458 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 CA9Q16790 459 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 BTBD8Q5XKL5 378 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF687Q8N1G0 1237 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC185Q8N715 623 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 KBTBD8Q8NFY9 601 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 P2RY11Q96G91 374 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-210ENST00000592582 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms