RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 SIN3BO75182 1162 aa11.5□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 ZMPSTE24O75844 475 aa11.5□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 ANXA9O76027 345 aa11.5□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 IGSF6O95976 241 aa11.5□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 HLA-DQB2P05538 268 aa11.5□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa11.5□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 LMX1AQ8TE12 382 aa11.5□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 LRRN3Q9H3W5 708 aa11.5□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 WHRNQ9P202 907 aa11.5□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.5□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 CHD5Q8TDI0 1954 aa11.49□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 ADH1BP00325 375 aa11.49□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 APRTP07741 180 aa11.49□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 C5AR1P21730 350 aa11.49□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 PSMB4P28070 264 aa11.49□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 CEP128Q6ZU80 1094 aa11.49□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 RD3Q7Z3Z2 195 aa11.49□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 SH2D3CQ8N5H7 860 aa11.49□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 C19orf60Q96EN9 201 aa11.49□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 FCRL5Q96RD9 977 aa11.49□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 MGME1Q9BQP7 344 aa11.49□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 FSD1LQ9BXM9 530 aa11.49□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC25A51Q9H1U9 297 aa11.49□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.49□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 HS3ST2Q9Y278 367 aa11.49□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.49□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 UQCRHLA0A096LP55 91 aa11.48□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 ERLIN1O75477 346 aa11.48□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 PEX11BO96011 259 aa11.48□□□□□ -0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 STK19P49842 368 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 ITGA8P53708 1063 aa11.48□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 PLTPP55058 493 aa11.48□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 MPP3Q13368 585 aa11.48□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 MORF4L2Q15014 288 aa11.48□□□□□ -0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 CYTH1Q15438 398 aa11.48□□□□□ -0.57
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