RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585907.1

PRKAR1A-209, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, human

TSL 2

Gene PRKAR1A, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CSNK1D	P48730	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MEOX1	P50221	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SUOX	P51687	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NDST2	P52849	883 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ADPRH	P54922	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	IL13RA1	P78552	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SHC2	P98077	582 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	BNC1	Q01954	994 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	OVGP1	Q12889	678 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GRM7	Q14831	915 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MLC1	Q15049	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	DPYSL2	Q16555	572 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	VSTM4	Q8IW00	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CFHR4	Q92496	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RAB7B	Q96AH8	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	OMD	Q99983	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CDH19	Q9H159	772 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	LRRC19	Q9H756	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CEP250	Q9BV73	2442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907		A0A1W2PR77	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TSPAN11	A1L157	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907		K7ERQ8	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CBX4	O00257	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	YKT6	O15498	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	OPHN1	O60890	802 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	KATNA1	O75449	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MTA2	O94776	668 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CER1	O95813	267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PEX11B	O96011	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CFI	P05156	583 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PSMA2	P25787	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MIP	P30301	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ADCY8	P40145	1251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RXRG	P48443	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PSMD8	P48556	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TAS2R38	P59533	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	IL10RB	Q08334	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GRIK2	Q13002	908 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	DPYS	Q14117	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GRM3	Q14832	879 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GPR19	Q15760	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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