RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	CLMP	Q9H6B4	373 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	PAK5	Q9P286	719 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCNK6	Q9Y257	313 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	RP1	P56715	2156 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRR19	A6NJB7	356 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	AGAP14	A8MT82	685 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	B4GAT1	O43505	415 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	CEP104	O60308	925 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	UGT1A9	O60656	530 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	MTX2	O75431	263 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRAMEF1	O95521	474 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	IFNB1	P01574	187 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	F3	P13726	295 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	UGT1A6	P19224	532 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	UGT1A1	P22309	533 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	UGT1A4	P22310	534 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSMA3	P25788	255 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCKBR	P32239	447 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	UGT1A3	P35503	534 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	UGT1A5	P35504	534 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDX1	P52945	283 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	XIAP	P98170	497 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	NFATC2	Q13469	925 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	SNX1	Q13596	522 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	GTF2H3	Q13889	308 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	PTPRCAP	Q14761	206 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	AVL9	Q8NBF6	648 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	GDAP1	Q8TB36	358 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	PATE1	Q8WXA2	126 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	TTC25	Q96NG3	672 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM74	Q96NL1	305 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCTD3	Q9Y597	815 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	BPTF	Q12830	3046 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501		A0A0G2JNG1	304 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501		H7C0S8	307 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	PPM1D	O15297	605 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	BRINP1	O60477	761 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	EML2	O95834	649 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	VCL	P18206	1134 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	CXCR5	P32302	372 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	RHD	Q02161	417 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCNC4	Q03721	635 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	BIRC2	Q13490	618 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	SEMA5A	Q13591	1074 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIR2DS5	Q14953	304 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	INSC	Q1MX18	579 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	STYX	Q8WUJ0	223 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM159	Q96B96	161 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	PBK	Q96KB5	322 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLC4	Q9NSK0	619 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLHL33	A6NCF5	533 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	MROH6	A6NGR9	719 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501		E7EVH7	732 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPR39	O43194	453 aa		13.43	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms