RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568682.5

KARS-210, Transcript of lysyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene KARS, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARS-210ENST00000568682 ESX1Q8N693 406 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 LEMD2Q8NC56 503 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 THAP4Q8WY91 577 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 GCNAQ96QF7 691 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 NMUR1Q9HB89 426 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 ACP6Q9NPH0 428 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 GKN1Q9NS71 199 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 CISHQ9NSE2 258 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 DTNAQ9Y4J8 743 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.51□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 PSMA7O14818 248 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 IKBKBO14920 756 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 POLBP06746 335 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 TPH1P17752 444 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 SLC5A2P31639 672 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 AVPR1AP37288 418 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 FMO5P49326 533 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 AP3M2P53677 418 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 VAMP2P63027 116 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 LRRC63Q05C16 580 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 INCA1Q0VD86 236 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 MTAPQ13126 283 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 MTF1Q14872 753 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 ZNF77Q15935 545 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 VSTM1Q6UX27 236 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 DTX2Q86UW9 622 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 TTC30AQ86WT1 665 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 NUP93Q8N1F7 819 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 LMO3Q8TAP4 145 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 UBA3Q8TBC4 463 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 SPATA18Q8TC71 538 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 FAM3CQ92520 227 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 FBXO32Q969P5 355 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 P2RY11Q96G91 374 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 SPATA17Q96L03 361 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 CRACR2AQ9BSW2 395 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 TRIM5Q9C035 493 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 CPQQ9Y646 472 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.5□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 OR2W5A6NFC9 320 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 B9A039 149 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 RAB27BO00194 218 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 CHADO15335 359 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 COCHO43405 550 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 TIMM44O43615 452 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 ACTL6BO94805 426 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 EGFP01133 1207 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 ADH4P08319 380 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 HMBSP08397 361 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 FAM200BP0CF97 657 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 SP9P0CG40 484 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 HKR1P10072 659 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 CHRNB1P11230 501 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 CAPN3P20807 821 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 CNTFP26441 200 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 KRT9P35527 623 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 AVPR1BP47901 424 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 RGS7P49802 495 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 PDE6CP51160 858 aa6.49□□□□□ -1.37
KARS-210ENST00000568682 AP2B1P63010 937 aa6.49□□□□□ -1.37
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