RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 EPHB4P54760 987 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 NAGLUP54802 743 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SELENOVP59797 346 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TIMM10P62072 90 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 DLG4P78352 724 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SLC39A6Q13433 755 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 DRP2Q13474 957 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SNX17Q15036 470 aa5.48□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 ADRM1Q16186 407 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 P3H1Q32P28 736 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 GTDC1Q4AE62 458 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 LRRC24Q50LG9 513 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CCNJQ5T5M9 372 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 METTL21CQ5VZV1 264 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SLFN13Q68D06 897 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 C4orf22Q6V702 233 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 BBS12Q6ZW61 710 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 USP45Q70EL2 814 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF365Q70YC5 407 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CYB5R4Q7L1T6 521 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 FRMD5Q7Z6J6 570 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ZSWIM9Q86XI8 627 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ELMOD2Q8IZ81 293 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 FNDC5Q8NAU1 212 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CHURC1Q8WUH1 139 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 GLMPQ8WWB7 406 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ZFYVE19Q96K21 471 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 QRFPRQ96P65 431 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 GAL3ST4Q96RP7 486 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ABHD1Q96SE0 405 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 POTEKPQ9BYX7 375 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 FAM192AQ9GZU8 254 aa5.48□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 RMND5AQ9H871 391 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 NGBQ9NPG2 151 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ELOVL2Q9NXB9 296 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ANKMY1Q9P2S6 941 aa5.48□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 NARFQ9UHQ1 456 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CHD4Q14839 1912 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CDHR2Q9BYE9 1310 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 AKAP11Q9UKA4 1901 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 A0A088AWK7 358 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 A0A0U1RQJ8 604 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1W2PPC4 97 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 RAB19A4D1S5 217 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 BTBD17A6NE02 478 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 EFCAB10A6NFE3 127 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 B4E1Z4 1266 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 UBE2Q2LH0YL09 131 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM77I1YAP6 450 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 AGRPO00253 132 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ALOX15BO15296 676 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TEX33O43247 280 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 VPS4BO75351 444 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SERPINB7O75635 380 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SERPINI2O75830 405 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 IL18RAPO95256 599 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TNFRSF6BO95407 300 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SYF2O95926 243 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ONECUT2O95948 504 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 BMP15O95972 392 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 KRT16P08779 473 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CD8BP10966 210 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CPA3P15088 417 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ITGB6P18564 788 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CPT2P23786 658 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CASP14P31944 242 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 GTF2H1P32780 548 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 GRK3P35626 688 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 KCNC1P48547 511 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SLC1A6P48664 564 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TMED10P49755 219 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SMSP52788 366 aa5.47□□□□□ -1.53
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