RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	FOXS1	O43638	330 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	KDELR3	O43731	214 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	SPOP	O43791	374 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	LRCH4	O75427	683 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	KATNA1	O75449	491 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	PALM	O75781	387 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	LY86	O95711	162 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	SRC	P12931	536 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	TCF4	P15884	667 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	ERCC2	P18074	760 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	CD6	P30203	668 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	CHRNA3	P32297	505 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	TPMT	P51580	245 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	PLK1	P53350	603 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	AIF1	P55008	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	RHOA	P61586	193 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	RAD51	Q06609	339 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	RIN1	Q13671	783 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	PLK5	Q496M5	336 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	KAZN	Q674X7	775 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	KLK6	Q92876	244 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	NTAN1	Q96AB6	310 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	PANX2	Q96RD6	677 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	GABRG3	Q99928	467 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PR48	441 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRD1	A4D1F6	860 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288		A8MX80	341 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288		J3KR12	359 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATXN3-238	ENST00000556288	PROSC	O94903	275 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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