RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 CASRP41180 1078 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 STAT5AP42229 794 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 CDK18Q07002 472 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 GTF2H3Q13889 308 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 ERV3-1Q14264 604 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 PDK1Q15118 436 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 IRGCQ6NXR0 463 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 NPNTQ6UXI9 565 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM92BQ6ZTR7 304 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 TMC3Q7Z5M5 1100 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 RFX6Q8HWS3 928 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 PLD5Q8N7P1 536 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 CXorf40BQ96DE9 158 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 TTC25Q96NG3 672 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 MAGEE1Q9HCI5 957 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 BPIFA1Q9NP55 256 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 OGFRQ9NZT2 677 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 IFNKQ9P0W0 207 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 ANAPC2Q9UJX6 822 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 CROTQ9UKG9 612 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 SDK2Q58EX2 2172 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 PMPCBO75439 489 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 KIAA0754O94854 1291 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 NDUFA10O95299 355 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 DLGAP3O95886 979 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 C9P02748 559 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 KRT1P04264 644 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 BPIP17213 487 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 VCLP18206 1134 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 F8A1P23610 371 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC19A1P41440 591 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 CLCNKAP51800 687 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 DCDC1P59894 354 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC18A3Q16572 532 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 CACHD1Q5VU97 1274 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 RSC1A1Q92681 617 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 TRIB3Q96RU7 358 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 TIMM29Q9BSF4 260 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC25A51Q9H1U9 297 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 UCK1Q9HA47 277 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 POT1Q9NUX5 634 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 UBP1Q9NZI7 540 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 KCTD3Q9Y597 815 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.94□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 CDC14CA4D256 554 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 PRR19A6NJB7 356 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 AURKAO14965 403 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 CHUKO15111 745 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 VEGFDO43915 354 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 AKR1B10O60218 316 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 TPM3P06753 285 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 HALP42357 657 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 CAPZBP47756 277 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 MAP7Q14244 749 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 GPR18Q14330 331 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 IL11RAQ14626 422 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC9A4Q6AI14 798 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 PPP1R3BQ86XI6 285 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 TTC30BQ8N4P2 665 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC40A1Q9NP59 571 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 NENFQ9UMX5 172 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa11.93□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 PIPSLA2A3N6 862 aa11.92□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 F5H423 210 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 SPAG6O75602 509 aa11.92□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 NDST3O95803 873 aa11.92□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM253P0C7T8 217 aa11.92□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 BRAFP15056 766 aa11.92□□□□□ -0.5
CTDSP2-205ENST00000549039 NR1D1P20393 614 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms