RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	PAF1	Q8N7H5	531 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	BBS2	Q9BXC9	721 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	WDR41	Q9HAD4	459 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	ALPK3	Q96L96	1907 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A0J9YYE9	177 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	PER2	O15055	1255 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	PFDN6	O15212	129 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	AP1G1	O43747	822 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBC1	P01850	177 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	ART3	Q13508	389 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	MYLK3	Q32MK0	819 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	LEMD2	Q8NC56	503 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	IRF7	Q92985	503 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193		H3BMM5	538 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	GPR39	O43194	453 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	ASL	P04424	464 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	NRF1	Q16656	503 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	KDM1B	Q8NB78	822 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193		Q9H521	79 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	SERPINA4	P29622	427 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	HNF1B	P35680	557 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	OR4D1	Q15615	310 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF77	Q15935	545 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	VOPP1	Q96AW1	172 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	GPR21	Q99679	349 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	SOBP	A7XYQ1	873 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	BNIP3L	O60238	219 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	RB1	P06400	928 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	TYR	P14679	529 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	IMPDH1	P20839	514 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	CACNG1	Q06432	222 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	SNX31	Q8N9S9	440 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	ADA2	Q9NZK5	511 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	GALP	Q9UBC7	116 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	CDYL	Q9Y232	598 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	MYO7A	Q13402	2215 aa		15.54	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		15.53	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	CLDN7	O95471	211 aa		15.53	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	15.53	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	ME2	P23368	584 aa		15.53	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	PTGER3	P43115	390 aa		15.53	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	NFKB2	Q00653	900 aa		15.53	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	CDKN3	Q16667	212 aa		15.53	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		15.53	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		15.53	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		15.53	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	15.53	■□□□□ 0.08
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	15.53	■□□□□ 0.08

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms