RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	SELENON	Q9NZV5	590 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPS13-208	ENST00000531908	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPS13-208	ENST00000531908	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPS13-208	ENST00000531908	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPS13-208	ENST00000531908	AK9	Q5TCS8	1911 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908		A0A0U1RQJ8	604 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	LINC01553	A4QN01	128 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	GPAA1	O43292	621 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	BAIAP3	O94812	1187 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SERPINB2	P05120	415 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SYT1	P21579	422 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	GYG1	P46976	350 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	CRY2	Q49AN0	593 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	FRMD1	Q8N878	549 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	NECAB1	Q8N987	351 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	WASF1	Q92558	559 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SGCD	Q92629	289 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	NEUROG1	Q92886	237 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	MED30	Q96HR3	178 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF479	Q96JC4	524 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	TIGD1	Q96MW7	591 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	MKLN1	Q9UL63	735 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	BTAF1	O14981	1849 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SPEF2	Q9C093	1822 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	NHS	Q6T4R5	1651 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	hDV102S1	A0JD36	115 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	STX6	O43752	255 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	PFKFB2	O60825	505 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	PAGE4	O60829	102 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SLC25A12	O75746	678 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	BBOX1	O75936	387 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SCGB1D1	O95968	90 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	FCGR1A	P12314	374 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	RRM1	P23921	792 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	ZXDB	P98169	803 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	GRAP	Q13588	217 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	CALCRL	Q16602	461 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	MMEL1	Q495T6	779 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	ADSSL1	Q8N142	457 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	MTMR6	Q9Y217	621 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	NFS1	Q9Y697	457 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	CKAP5	Q14008	2032 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	MYH3	P11055	1940 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	SBF2	Q86WG5	1849 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	LY75	O60449	1722 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS13-208	ENST00000531908	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6

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