RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 FGGP02679 453 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR89BP0CG08 455 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS56P0CW18 603 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 F3P13726 295 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 LSSP48449 732 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 INHBCP55103 352 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CFHR1Q03591 330 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 SEPT6Q14141 434 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 POU6F1Q14863 301 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 DET1Q7L5Y6 550 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 BRSK1Q8TDC3 778 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 TIMM29Q9BSF4 260 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM96AQ9H5X1 160 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ARNT2Q9HBZ2 717 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC187A0A096LP49 1063 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 C2orf81A6NN90 581 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 KMOO15229 486 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 VEGFDO43915 354 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 SRP72O76094 671 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 BRAFP15056 766 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ITPKBP27987 946 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CD1CP29017 333 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CCKBRP32239 447 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 GRIA1P42261 906 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 DRG2P55039 364 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 HHEXQ03014 270 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 NFATC2Q13469 925 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 BIRC2Q13490 618 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGA9Q13797 1035 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 IYDQ6PHW0 289 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 USP53Q70EK8 1073 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 RCBTB1Q8NDN9 531 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52K1Q8NGK4 314 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 DTX3LQ8TDB6 740 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ETNK1Q9HBU6 452 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF148Q9UQR1 794 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 NRDCO43847 1150 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP104O60308 925 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 PPFIA2O75334 1257 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 DXOO77932 396 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CPNE6O95741 557 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ITIH1P19827 911 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 MPSTP25325 297 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL10P27635 214 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 AKT1P31749 480 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF2H3Q13889 308 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 C16orf72Q14CZ0 275 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 COL28A1Q2UY09 1125 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC38Q502W7 563 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 LDLRAP1Q5SW96 308 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 PHF19Q5T6S3 580 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 XKR5Q6UX68 686 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 REXO1L1PQ8IX06 675 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF398Q8TD17 642 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ASB8Q9H765 288 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNK4Q9NYG8 393 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR37Q9Y2I8 494 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 LOXL2Q9Y4K0 774 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A087WV48 116 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52A4PA6NMU1 304 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 PDZK1P1A8MUH7 402 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CRTAMO95727 393 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 MC4RP32245 332 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ETV5P41161 510 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNJ1P48048 391 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CLCNKAP51800 687 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB11FIP2Q7L804 512 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC74BQ96LY2 380 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms