RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489053.1

HDAC6-232, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 539 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.01□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.01□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.01□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ANKRD36A6QL64 1941 aa9.01□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 HGSO14964 777 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 PPM1DO15297 605 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 KCNJ13O60928 360 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 HGFP14210 728 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 AMD1P17707 334 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ITGALP20701 1170 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 SLC5A2P31639 672 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 FASLGP48023 281 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 B4GALNT1Q00973 533 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 TLE3Q04726 772 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 SPARCL1Q14515 664 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 KRT33BQ14525 404 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 CHRNA6Q15825 494 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 PARP6Q2NL67 630 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 IYDQ6PHW0 289 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 IGF2-ASQ6U949 168 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 GSTA5Q7RTV2 222 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 GPR155Q7Z3F1 870 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 LINC00523Q86TU6 105 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 AMZ2Q86W34 360 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 FAM129CQ86XR2 697 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 TMEM139Q8IV31 216 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 SFRP1Q8N474 314 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 TTC30BQ8N4P2 665 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 OR4K2Q8NGD2 314 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 OR4D9Q8NGE8 314 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 CCDC74BQ96LY2 380 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 WDR24Q96S15 920 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ASB8Q9H765 288 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 IL26Q9NPH9 171 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ASCL3Q9NQ33 180 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 PRDM8Q9NQV8 689 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 CPNE7Q9UBL6 633 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 TBC1D29Q9UFV1 150 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 KLHL3Q9UH77 587 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ADGRG1Q9Y653 693 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ARL5AQ9Y689 179 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 PTPRBP23467 1997 aa9□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ATRXP46100 2492 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 CACNA1GO43497 2377 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 OR2AG2A6NM03 316 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 A8MU76 341 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 B4GAT1O43505 415 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 UGT1A9O60656 530 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 RASSF9O75901 435 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 UGT1A6P19224 532 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 UGT1A1P22309 533 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 UGT1A4P22310 534 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 MPSTP25325 297 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 CD1CP29017 333 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 UGT1A3P35503 534 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ARL4DP49703 201 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ATP1A2P50993 1020 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 PDX1P52945 283 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 EPHA4P54764 986 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 TMPRSS15P98073 1019 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 LAMB3Q13751 1172 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 GSE1Q14687 1217 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 NR1D2Q14995 579 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 PLCL1Q15111 1095 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 KLHL35Q6PF15 583 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 TMEM220Q6QAJ8 160 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 DET1Q7L5Y6 550 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 TAS2R42Q7RTR8 314 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 DDHD1Q8NEL9 900 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC6-232ENST00000489053 TRIM58Q8NG06 486 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms