RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484375.5

ARPC1B-218, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

TSL 3

Gene ARPC1B, Length 785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1B-218ENST00000484375 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 CENPUQ71F23 418 aa22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 TAF8Q7Z7C8 310 aa22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 SERPINA9Q86WD7 417 aa22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 TIMM29Q9BSF4 260 aa22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 CARD6Q9BX69 1037 aa22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 DLL3Q9NYJ7 618 aa22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 FTSJ1Q9UET6 329 aa22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 TM4SF5O14894 197 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 FFAR2O15552 330 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 SH3BP5O60239 455 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 TTPAP49638 278 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 C1orf61Q13536 156 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 PACS1Q6VY07 963 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 EID2Q8N6I1 236 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 SEC14L1Q92503 715 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 ART4Q93070 314 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 CLPBQ9H078 707 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.29■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 TP73O15350 636 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 VAPBO95292 243 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 FUCA1P04066 466 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 CEACAM1P13688 526 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 NSG1P42857 185 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 RPIAP49247 311 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 SPANXN3Q5MJ09 141 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 KCTD16Q68DU8 428 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 FAM181AQ8N9Y4 354 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 CALML6Q8TD86 181 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa22.28■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 OR51F1A6NGY5 319 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 E7ESA3 106 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 YY2O15391 372 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 AP2A2O94973 939 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 GSTM1P09488 218 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 CLCNKAP51800 687 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 CTBSQ01459 385 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 GSTM4Q03013 218 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 LONRF1Q17RB8 773 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 INSCQ1MX18 579 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 DEFB133Q30KQ1 61 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 BCL7AQ4VC05 210 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 CRTC3Q6UUV7 619 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 TCF12Q99081 682 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 BTBD3Q9Y2F9 522 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 CEP250Q9BV73 2442 aa22.27■■□□□ 1.16
ARPC1B-218ENST00000484375 CBFA2T3O75081 653 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 GIMD1P0DJR0 217 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 ACP5P13686 325 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC2A4P14672 509 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 OGNP20774 298 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 PMLP29590 882 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 ACTR1BP42025 376 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 PLTPP55058 493 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 ACTR1AP61163 376 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC7A5Q01650 507 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 GUCY2DQ02846 1103 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 CRYMQ14894 314 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 DBN1Q16643 649 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 CES3Q6UWW8 571 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 GLRX5Q86SX6 157 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 GPR150Q8NGU9 434 aa22.26■■□□□ 1.15
ARPC1B-218ENST00000484375 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms