RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484179.5

USP34-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 927 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-215	ENST00000484179	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	C5orf42	Q9H799	3197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	LINC00473	A8K010	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	PTGES	O14684	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	B4GALT5	O43286	388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	PFKFB2	O60825	505 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	KAT7	O95251	611 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	NPS	P0C0P6	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	MCF2	P10911	925 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	KCNE1	P15382	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	CYP3A5	P20815	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ABCD3	P28288	659 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	PGM1	P36871	562 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	CLCNKB	P51801	687 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ROR1	Q01973	937 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	PDIA5	Q14554	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	NAB2	Q15742	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	BAK1	Q16611	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	CD302	Q8IX05	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	NPAS1	Q99742	590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	CHRNB1	P11230	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	LYL1	P12980	280 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	TDGF1	P13385	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	NDUFB7	P17568	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	IGFBP2	P18065	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	DUSP1	P28562	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	CDC25C	P30307	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	GDI1	P31150	447 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	GRIA3	P42263	894 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	DPP6	P42658	865 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	DCAF7	P61962	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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