RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462229.1

PHF19-208, Transcript of PHD finger protein 19, human

TSL 2

Gene PHF19, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF19-208	ENST00000462229	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	GPR150	Q8NGU9	434 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	IFT81	Q8WYA0	676 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	OR2M4	Q96R27	311 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	GPR34	Q9UPC5	381 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	PIEZO1	Q92508	2521 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	LRP4	O75096	1905 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	SCAMP1	O15126	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	KMO	O15229	486 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	AQP9	O43315	295 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	SDC3	O75056	442 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	TTPA	P49638	278 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	IL9R	Q01113	521 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	ELOC	Q15369	112 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	NEPRO	Q6NW34	567 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	SLC25A45	Q8N413	288 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	NETO1	Q8TDF5	533 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	LMX1A	Q8TE12	382 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	TCF12	Q99081	682 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	LRRC61	Q9BV99	259 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PHF19-208	ENST00000462229	LMO7DN	F2Z398	122 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	PFDN6	O15212	129 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	CD59	P13987	128 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	PML	P29590	882 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	NSG1	P42857	185 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	B4GALNT1	Q00973	533 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	C1orf61	Q13536	156 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	LRP8	Q14114	963 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	SEMA3A	Q14563	771 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	PACS1	Q6VY07	963 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	CCDC25	Q86WR0	208 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	GKN2	Q86XP6	184 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	PALM2	Q8IXS6	379 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	CALML6	Q8TD86	181 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	CFAP36	Q96G28	342 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	CLPB	Q9H078	707 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	LAMA1	P25391	3075 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	TPP1	O14773	563 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	FLRT2	O43155	660 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	KCNJ13	O60928	360 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	NDUFS3	O75489	264 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	AP2A2	O94973	939 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	GSTA2	P09210	222 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	ECHS1	P30084	290 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	GRK6	P43250	576 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	MAGEA4	P43358	317 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	CLCNKA	P51800	687 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	CTSC	P53634	463 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PHF19-208	ENST00000462229	CTBS	Q01459	385 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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