RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 AGAP14A8MT82 685 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 BRINP1O60477 761 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX2O60749 519 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK14O94921 469 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNB1P01574 187 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 FGGP02679 453 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 MPOP05164 745 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PYGLP06737 847 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 GLB1P16278 677 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CD1CP29017 333 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ETV5P41161 510 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC19A1P41440 591 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TERF1P54274 439 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPSAP1Q14558 356 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 POU6F1Q14863 301 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 NR1D2Q14995 579 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CLCA4Q14CN2 919 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 RTP5Q14D33 572 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ISXQ2M1V0 245 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 P3H1Q32P28 736 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 IYDQ6PHW0 289 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 USP53Q70EK8 1073 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SPRED1Q7Z699 444 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PROSER1Q86XN7 944 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNJLQ8IV13 435 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM58Q8NG06 486 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF398Q8TD17 642 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 GLMNQ92990 594 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CRELD1Q96HD1 420 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 NRTNQ99748 197 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CASS4Q9NQ75 786 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 KLC4Q9NSK0 619 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 HACD3Q9P035 362 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 APPL1Q9UKG1 709 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SATB2Q9UPW6 733 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 RAXQ9Y2V3 346 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 MGAQ8IWI9 3026 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2AG2A6NM03 316 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf80F5H4A9 247 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SMAPO00193 183 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SUN1O94901 812 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK4P11802 303 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 HGFP14210 728 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PNLIPP16233 465 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 MPSTP25325 297 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMA3P25788 255 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ALDH4A1P30038 563 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CSF2RBP32927 897 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 RPIAP49247 311 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CLCNKAP51800 687 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SEMA5AQ13591 1074 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 NFE2L1Q14494 772 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SEMA3AQ14563 771 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF534Q76KX8 674 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 DET1Q7L5Y6 550 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.9□□□□□ -1.3
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