RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa25.95■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 TMC3Q7Z5M5 1100 aa25.95■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 CPNE8Q86YQ8 564 aa25.95■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 MIB2Q96AX9 1013 aa25.95■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 TRIB3Q96RU7 358 aa25.95■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 LCMT1Q9UIC8 334 aa25.95■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 VEGFDO43915 354 aa25.94■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 RASSF9O75901 435 aa25.94■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 FGF5P12034 268 aa25.94■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 TAS2R40P59535 323 aa25.94■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 ZBED6P86452 979 aa25.94■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 ZBTB17Q13105 803 aa25.94■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 ERV3-1Q14264 604 aa25.94■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 UVRAGQ9P2Y5 699 aa25.94■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 SHOC2Q9UQ13 582 aa25.94■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 PLAAQ9Y263 795 aa25.94■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa25.94■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa25.94■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 LRRK2Q5S007 2527 aa25.94■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 RECKO95980 971 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 MT-ND3P03897 115 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 CCNYL3P0C7X3 344 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 BRAFP15056 766 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 CD97P48960 835 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 AGAP9Q5VTM2 703 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 WASH2PQ6VEQ5 465 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 ATCAYQ86WG3 371 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 TEX19Q8NA77 164 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 KLHL6Q8WZ60 621 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 ZDHHC12Q96GR4 267 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 RNF157Q96PX1 679 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 SLC40A1Q9NP59 571 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 WASH6PQ9NQA3 447 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 EPHA6Q9UF33 1036 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF711Q9Y462 761 aa25.93■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 NBASA2RRP1 2371 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 KATNA1O75449 491 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 FURINP09958 794 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 IDSP22304 550 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 PBX1P40424 430 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 CACHD1Q5VU97 1274 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 PPP1R3BQ86XI6 285 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF547Q8IVP9 402 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 RSC1A1Q92681 617 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 IQCDQ96DY2 449 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 GPR63Q9BZJ6 419 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 RAB33BQ9H082 229 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa25.92■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 SPAG6O75602 509 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 RFPL1O75677 317 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 CDK14O94921 469 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 SLC4A1P02730 911 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 PIRTP0C851 137 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 NR1D1P20393 614 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 KDELR1P24390 212 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 RPL10P27635 214 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 GPR18Q14330 331 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 IQCB1Q15051 598 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 NT5DC3Q86UY8 548 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 CXorf40BQ96DE9 158 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 RNF31Q96EP0 1072 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 ELMO2Q96JJ3 720 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 VPS35Q96QK1 796 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 PADI1Q9ULC6 663 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 CAPN11Q9UMQ6 739 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 NENFQ9UMX5 172 aa25.91■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF487B1APH4 448 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 MTSS1O43312 755 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 MTX2O75431 263 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 CREG1O75629 220 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 BPIP17213 487 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 VCLP18206 1134 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 PMS2P54278 862 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 CDK18Q07002 472 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 DNASE1L3Q13609 305 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 SLC14A2Q15849 920 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 ASB18Q6ZVZ8 466 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 PLD5Q8N7P1 536 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 RAPGEF5Q92565 580 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 SLC25A51Q9H1U9 297 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 HEY1Q9Y5J3 304 aa25.9■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 CDC14CA4D256 554 aa25.89■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 OR52A4PA6NMU1 304 aa25.89■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 C21orf140B9A014 251 aa25.89■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 K7EM74 188 aa25.89■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 H2AFZP0C0S5 128 aa25.89■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 NELFEP18615 380 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 AP1B1Q10567 949 aa25.89■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 PCSK7Q16549 785 aa25.89■■□□□ 1.74
PBRM1-218ENST00000458294 FAM92BQ6ZTR7 304 aa25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms