RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 RBFAQ8N0V3 343 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 BBS5Q8N3I7 341 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 PCDH19Q8TAB3 1148 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 TLR10Q9BXR5 811 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC19Q9H756 370 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 UVRAGQ9P2Y5 699 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ATXN10Q9UBB4 475 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 POLG2Q9UHN1 485 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 NENFQ9UMX5 172 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 SNX10Q9Y5X0 201 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD36A6QL64 1941 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 STMND1H3BQB6 276 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 SLC2A4P14672 509 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF24P17028 368 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 PSMA3P25788 255 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 EPHB2P29323 1055 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 GPLD1P80108 840 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ATP11AP98196 1134 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 B4GALNT1Q00973 533 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 FMO1Q01740 532 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 IL10RBQ08334 325 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 PTP4A2Q12974 167 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 RPS6KA1Q15418 735 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 CYTH1Q15438 398 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 LINC00303Q3SY05 128 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 AGBL2Q5U5Z8 902 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ACAD10Q6JQN1 1059 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ENPP7Q6UWV6 458 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF765Q7L2R6 523 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ANKS4BQ8N8V4 417 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 FNIP1Q8TF40 1166 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 NACC2Q96BF6 587 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 FAM136AQ96C01 138 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 PBKQ96KB5 322 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD27Q96NW4 1050 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 KRT12Q99456 494 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ISCUQ9H1K1 167 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 MKS1Q9NXB0 559 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 GULP1Q9UBP9 304 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 AMFRQ9UKV5 643 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 RNF103O00237 685 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 CES2O00748 559 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 SUV39H1O43463 412 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 RAD51CO43502 376 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 RECKO95980 971 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 FUT4P22083 530 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ENPP1P22413 925 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 HADHBP55084 474 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 DPTQ07507 201 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 BCL2L1Q07817 233 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 KLC1Q07866 573 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 COX10Q12887 443 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 INPP5AQ14642 412 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 TCEAL1Q15170 157 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 DNAJC24Q6P3W2 148 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ASRGL1Q7L266 308 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 PEX26Q7Z412 305 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 PIM3Q86V86 326 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 JAMLQ86YT9 394 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 UBL4BQ8N7F7 174 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 OR4D9Q8NGE8 314 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 SLC20A1Q8WUM9 679 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 FATE1Q969F0 183 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 SLC35B4Q969S0 331 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 SH3KBP1Q96B97 665 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF653Q96CK0 615 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 KLHL29Q96CT2 875 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ERP27Q96DN0 273 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 POM121Q96HA1 1249 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 DHRS1Q96LJ7 313 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 SYT11Q9BT88 431 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 TEX101Q9BY14 249 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 WDR26Q9H7D7 661 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 AMACRQ9UHK6 382 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 A0A1W2PQM1 296 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-204ENST00000440835 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms