RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRNA1P02708 482 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GFAPP14136 432 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NAGAP17050 411 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PGAM1P18669 254 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CES1P23141 567 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PKLRP30613 574 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRP35270 261 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 AVPR1AP37288 418 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 HK2P52789 917 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CD83Q01151 205 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GBE1Q04446 702 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PGM5Q15124 567 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 DUSP7Q16829 419 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GRTP1Q5TC63 336 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF544Q6NX49 715 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC14AQ86T13 490 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RETREG3Q86VR2 466 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC4FQ8N1N0 589 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NODALQ96S42 347 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CPXM1Q96SM3 734 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 OMDQ99983 421 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 POLHQ9Y253 713 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 Q9Y3F1 56 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SCO1O75880 301 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SBK3P0C264 359 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FCGR1AP12314 374 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 IFI30P13284 250 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RAD52P43351 418 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEA12P43365 314 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HTR3AP46098 478 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 LIMK2P53671 638 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SPP2Q13103 211 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SEZ6Q53EL9 994 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 BEND5Q7L4P6 421 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PLD3Q8IV08 490 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HID1Q8IV36 788 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZIC5Q96T25 663 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GAD1Q99259 594 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 C8orf4Q9NR00 106 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GJD2Q9UKL4 321 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC39A10Q9ULF5 831 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NR5A2O00482 541 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TREHO43280 583 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 EXTL3O43909 919 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6AP2O75787 350 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP17A1P05093 508 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MPOP05164 745 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT19P08727 400 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRM3P20309 590 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPA14Q0VDF9 509 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ORC1Q13415 861 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 OLIG2Q13516 323 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PPA1Q15181 289 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 LCN8Q6JVE9 175 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 STK32CQ86UX6 486 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 P2RY8Q86VZ1 359 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 KCTD4Q8WVF5 259 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC30A3Q99726 388 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NECTIN3Q9NQS3 549 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PXMP2Q9NR77 195 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CISHQ9NSE2 258 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms