RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429270.1

BBX-210, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 4

Gene BBX, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-210ENST00000429270 BMP5P22003 454 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 SLC16A2P36021 539 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 GPR12P47775 334 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 LMAN1P49257 510 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 CLCN5P51795 746 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 SNAP25P60880 206 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 SLC18A2Q05940 514 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 FGFBP1Q14512 234 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 TMEM266Q2M3C6 531 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 RAB41Q5JT25 222 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 FAM57BQ71RH2 274 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 TMC8Q8IU68 726 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 DDIASQ8IXT1 998 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 CADM3Q8N126 398 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 LRRC57Q8N9N7 239 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 ZNF398Q8TD17 642 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 TXLNGYQ9BZA5 131 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 DCTPP1Q9H773 170 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 VCANP13611 3396 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 BDP1A6H8Y1 2624 aa5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 EBAG9O00559 213 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 GPAA1O43292 621 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 NKX2-2O95096 273 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 APOA4P06727 396 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 HOXB5P09067 269 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 TFPIP10646 304 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 IL7RP16871 459 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 TMEM11P17152 192 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 TDO2P48775 406 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 CLDN2P57739 230 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 ITGADQ13349 1161 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 OLIG2Q13516 323 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 PSMD6Q15008 389 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 BMP2KLQ5H9B9 411 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 ENTPD8Q5MY95 495 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 PCSK4Q6UW60 755 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 SERPINA11Q86U17 422 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 SLC25A41Q8N5S1 370 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 OR4N2Q8NGD1 307 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 ARNTL2Q8WYA1 636 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 RNF183Q96D59 192 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 PGAM5Q96HS1 289 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 CTAGE1Q96RT6 745 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 RAD9AQ99638 391 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 FAM118BQ9BPY3 351 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 TEX12Q9BXU0 123 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 NACAP1Q9BZK3 213 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 PLK2Q9NYY3 685 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 MCM3APO60318 1980 aa5.85□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 A0A1W2PQF6 199 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 IFNL4K9M1U5 179 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 CTDSP2O14595 271 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 NMT2O60551 498 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 CXCL10P02778 98 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 PRR35P0CG20 571 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 CTPS1P17812 591 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 EPHB2P29323 1055 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 ACVRL1P37023 503 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 UBA7P41226 1012 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 GALCP54803 685 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 TMPRSS3P57727 454 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 GHRHRQ02643 423 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 IKQ13123 557 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 IRF3Q14653 427 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 RASA2Q15283 850 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 ALX1Q15699 326 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 TCTN1Q2MV58 587 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 ALG11Q2TAA5 492 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 LEXMQ3ZCV2 418 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 SPECC1Q5M775 1068 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.84□□□□□ -1.47
BBX-210ENST00000429270 LCTLQ6UWM7 567 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms