RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIMM29Q9BSF4 260 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRE3Q9BY15 652 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DTLQ9NZJ0 730 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC23A2Q9UGH3 650 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCND3Q9UK17 655 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BLACEA4D250 179 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC14CA4D256 554 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMTNL1A8MU46 457 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KMOO15229 486 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KATNA1O75449 491 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC4A1P02730 911 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGF5P12034 268 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMS2P54278 862 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MLLT10P55197 1068 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB17Q13105 803 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDK2Q15119 407 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NFKBIBQ15653 356 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASB18Q6ZVZ8 466 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPNE8Q86YQ8 564 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PQLC3Q8N755 202 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNYQ8ND76 341 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLYATL1Q969I3 302 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNK1O00180 336 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPAG6O75602 509 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JCHAINP01591 159 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNYL3P0C7X3 344 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRAFP15056 766 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNASE1L3Q13609 305 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACHD1Q5VU97 1274 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYB5D1Q6P9G0 228 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM135Q86UB9 458 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R3BQ86XI6 285 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP7D3Q8IWC1 876 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIB3Q96RU7 358 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TWSG1Q9GZX9 223 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRD8Q9H0E9 1235 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAD18Q9NS91 495 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLK1Q9UKI8 766 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHOC2Q9UQ13 582 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF711Q9Y462 761 aa12.95□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087X0T9 212 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52A4PA6NMU1 304 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VEGFDO43915 354 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTX2O75431 263 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CREG1O75629 220 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBD3O95983 291 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MT-ND3P03897 115 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPING1P05155 500 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT7P08729 469 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIRTP0C851 137 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM228BP0C875 321 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL10P27635 214 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASP14P31944 242 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R40P59535 323 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR18Q14330 331 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR1I3Q14994 352 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGAP9Q5VTM2 703 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRGCQ6NXR0 463 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WASH2PQ6VEQ5 465 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM92BQ6ZTR7 304 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMC3Q7Z5M5 1100 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF547Q8IVP9 402 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNTD1Q8N815 330 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CT55Q8WUE5 264 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL6Q8WZ60 621 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXorf40BQ96DE9 158 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC12Q96GR4 267 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEE1Q9HCI5 957 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC40A1Q9NP59 571 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LHX9Q9NQ69 397 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WASH6PQ9NQA3 447 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPHA6Q9UF33 1036 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PADI1Q9ULC6 663 aa12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PQJ5 194 aa12.93□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIPSLA2A3N6 862 aa12.93□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C21orf140B9A014 251 aa12.93□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA6L22H0YM25 854 aa12.93□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PROSCO94903 275 aa12.93□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK14O94921 469 aa12.93□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIAF1O95411 115 aa12.93□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RECKO95980 971 aa12.93□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDGFAP04085 211 aa12.93□□□□□ -0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BPIP17213 487 aa12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms