RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SHISA4Q96DD7 197 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 GRIN2DO15399 1336 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 HLA-DQA2P01906 255 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SUSD3Q96L08 255 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 GSTT1P30711 240 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CAP1Q01518 475 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2T34Q8NGX1 318 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2T3Q8NH03 318 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 LPGAT1Q92604 370 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 B3GALT6Q96L58 329 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 U3KQV3 271 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 G3V2T6 193 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 GABRDO14764 452 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4F21O95013 312 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM163BP0C2L3 166 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CFAP206Q8IYR0 622 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ENKURQ8TC29 256 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RWDD3Q9Y3V2 267 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0U1RQF3 1178 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 AQP1P29972 269 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RIPK1Q13546 671 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 AMER2Q8N7J2 671 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC189A1A4V9 331 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 NPHS1O60500 1241 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 NRLP54845 237 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS24P62847 133 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT1A9O60656 530 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 C4BPBP20851 252 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PEX6Q13608 980 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 DPYSQ14117 519 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF671Q8TAW3 534 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 OSBPL2Q9H1P3 480 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT1A7Q9HAW7 530 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT1A10Q9HAW8 530 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT1A8Q9HAW9 530 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 HIPK1Q86Z02 1210 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 GMLQ99445 158 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RPL4P36578 427 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 IDH3AP50213 366 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP4F8P98187 520 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SULT1C3Q6IMI6 304 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM47BQ8NA70 645 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL32Q96NJ5 620 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 HBEGFQ99075 208 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SEMA3GQ9NS98 782 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CIDEBQ9UHD4 219 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CAPN1P07384 714 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 LSM3P62310 102 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ERICH5Q6P6B1 374 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PHC3Q8NDX5 983 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 OR14C36Q8NHC7 312 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP4B1P13584 511 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 NELFEP18615 380 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PRDX6P30041 224 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CHIT1Q13231 466 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 TPGS2Q68CL5 300 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL35Q6PF15 583 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 MPP5Q8N3R9 675 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 C9JVG2 144 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNE1P15382 129 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 DGKGP49619 791 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CIB1Q99828 191 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 TCEA3O75764 348 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 GRIA1P42261 906 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 C2orf80Q0P641 193 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 KBTBD2Q8IY47 623 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 EXD2Q9NVH0 621 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ERVW-1Q9UQF0 538 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CAPN8A6NHC0 703 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 NSG1P42857 185 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 HCAR3P49019 387 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CCR3P51677 355 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 LIPEQ05469 1076 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 REP15Q6BDI9 236 aa21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms