RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414558.2

ATG4C-204, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4C, Length 464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4C-204	ENST00000414558		A0A0G2JNG1	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	CIDEA	O60543	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ICAM1	P05362	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	CCR9	P51686	369 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	FRMD1	Q8N878	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	KCNK5	O95279	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	NR3C1	P04150	777 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	CLEC3B	P05452	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	HOXC8	P31273	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	LRR1	Q96L50	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	CLIC2	O15247	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	NPHP1	O15259	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	AGR2	O95994	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	TFAP2A	P05549	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	RGS2	P41220	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	PERP	Q96FX8	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ASCL2	Q99929	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	TMEM63A	O94886	807 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	RGS19	P49795	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	GNB1	P62873	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ANO5	Q75V66	913 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558		A0A1B0GU03	582 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	WISP2	O76076	250 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	BMP10	O95393	424 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	LIPF	P07098	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	KRT19	P08727	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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