RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 TAS2R39P59534 338 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 ARF5P84085 180 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 ITGA9Q13797 1035 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 GALNT3Q14435 633 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 LIPMQ5VYY2 423 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 PACS2Q86VP3 889 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 GPATCH11Q8N954 259 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 KCTD4Q8WVF5 259 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 HDAC10Q969S8 669 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 CD93Q9NPY3 652 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 DNAJC28Q9NX36 388 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 HCN2Q9UL51 889 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 OR51B4Q9Y5P0 310 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 KNL1Q8NG31 2342 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 COL12A1Q99715 3063 aa17■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 E2F8A0AVK6 867 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 GOLGA8CPA6NN73 597 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 TARM1B6A8C7 271 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 CBX4O00257 560 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 FCHO1O14526 889 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 ITM2AO43736 263 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 MGRN1O60291 552 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 T-ENOLP0DO92 83 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 GMPRP36959 345 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 ARSDP51689 593 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 AQP5P55064 265 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 CFHR1Q03591 330 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 DHCR24Q15392 516 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 MPP7Q5T2T1 576 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 MRNIPQ6NTE8 343 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 CNSTQ6PJW8 725 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 HTR3DQ70Z44 454 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 CEP97Q8IW35 865 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 PHTF2Q8N3S3 785 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 GPR78Q96P69 363 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 OMDQ99983 421 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 KLC4Q9NSK0 619 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 LHX3Q9UBR4 397 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 CYP8B1Q9UNU6 501 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 MYOFQ9NZM1 2061 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 PTPN13Q12923 2485 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 S1PR4O95977 384 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 APODP05090 189 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 KCNJ2P63252 427 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 BNC1Q01954 994 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 KDSRQ06136 332 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 RIPK1Q13546 671 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 TYSND1Q2T9J0 566 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 AFTPHQ6ULP2 937 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 DBX2Q6ZNG2 339 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 RGL4Q8IZJ4 473 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 GALNT15Q8N3T1 639 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 TMEM151AQ8N4L1 468 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 OR6P1Q8NGX9 317 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 ERLEC1Q96DZ1 483 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 SCYL1Q96KG9 808 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 CD248Q9HCU0 757 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 XPR1Q9UBH6 696 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 HAO1Q9UJM8 370 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 COL6A6A6NMZ7 2263 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 ANKRD36A6QL64 1941 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 A0A1W2PQF6 199 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 LEFTY2O00292 366 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 AURKAO14965 403 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 HSPA4LO95757 839 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 CD160O95971 181 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 SBK3P0C264 359 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 SAT1P21673 171 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRC-206ENST00000413409 CALB2P22676 271 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms