RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A0G2JNG1 304 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 KIR2DS3K7RE56 304 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SNX2O60749 519 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 METTL18O95568 372 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 GDF10P55107 478 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 GPLD1P80108 840 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 HHEXQ03014 270 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 KIR2DS5Q14953 304 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 INSCQ1MX18 579 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 C11orf96Q7Z7L8 435 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SPACA3Q8IXA5 215 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC45Q96CN5 670 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC25Q96NG3 672 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC38A3Q99624 504 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 C19orf43Q9BQ61 176 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SMOXQ9NWM0 555 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 IGSF10Q6WRI0 2623 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR39O43194 453 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CA5AP35218 305 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CCZ1BP86790 482 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 PDE1BQ01064 536 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 GTF2H3Q13889 308 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SPARCL1Q14515 664 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 RPS6KA1Q15418 735 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 PHF19Q5T6S3 580 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 NKAIN2Q5VXU1 208 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC9B2Q86UD5 537 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 PDZD3Q86UT5 571 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF398Q8TD17 642 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SH3KBP1Q96B97 665 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 RTP4Q96DX8 246 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CMKLR1Q99788 373 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 DPYSL5Q9BPU6 564 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 LOXL2Q9Y4K0 774 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 KCTD3Q9Y597 815 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 MGAQ8IWI9 3026 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CRTAMO95727 393 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 JMJD7P0C870 316 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 HGFP14210 728 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 LIMK2P53671 638 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CFHR1Q03591 330 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TLE3Q04726 772 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 P3H1Q32P28 736 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 AVL9Q8NBF6 648 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNE4Q8WWG9 221 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CRELD1Q96HD1 420 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 DPH1Q9BZG8 443 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 LIASO43766 372 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNJ13O60928 360 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SRP72O76094 671 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 PRAMEF1O95521 474 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CSF2RBP32927 897 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 XIAPP98170 497 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 NFATC2Q13469 925 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM71Q6P5X7 295 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 OR10G6Q8NH81 332 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms