RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 PKD2L2Q9NZM6 624 aa13.19□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 TRIM10Q9UDY6 481 aa13.19□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 KCND3Q9UK17 655 aa13.19□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 MYO6Q9UM54 1294 aa13.19□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 SCINQ9Y6U3 715 aa13.19□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 CREBBPQ92793 2442 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 CHUKO15111 745 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 PIRTP0C851 137 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 FOLR1P15328 257 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 COL8A1P27658 744 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 CASP14P31944 242 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 CD86P42081 329 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 ARSEP51690 589 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 DRG2P55039 364 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 TYRO3Q06418 890 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 GPR18Q14330 331 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 GALNT3Q14435 633 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 KRT81Q14533 505 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 STX1AQ16623 288 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 INSCQ1MX18 579 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC122Q5T0U0 273 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 IRGCQ6NXR0 463 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 PRSS42Q7Z5A4 293 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 LRRC49Q8IUZ0 686 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF547Q8IVP9 402 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 TRIM48Q8IWZ4 208 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 SSC4DQ8WTU2 575 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 ISCUQ9H1K1 167 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 TRIM39Q9HCM9 518 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 SLC40A1Q9NP59 571 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 AIPL1Q9NZN9 384 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 DNPEPQ9ULA0 475 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 SHOC2Q9UQ13 582 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 PDZK1P1A8MUH7 402 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 NELFEP18615 380 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 CES1P23141 567 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 CCNCP24863 283 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 PRKCIP41743 596 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 CAPZBP47756 277 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 CCL11P51671 97 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 RPL26P61254 145 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 KLHL30Q0D2K2 578 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 IL10RAQ13651 578 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 DPYSL3Q14195 570 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 PPP1R3BQ86XI6 285 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 GAS2L3Q86XJ1 694 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 AVL9Q8NBF6 648 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 FAM71BQ8TC56 605 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 CCHCR1Q8TD31 782 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 TSGA13Q96PP4 275 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 GRPEL1Q9HAV7 217 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 ANO10Q9NW15 660 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 LUZP4Q9P127 313 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 WDR37Q9Y2I8 494 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 SPTBP11277 2137 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 RGSL1A5PLK6 1076 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 ARGFXA6NJG6 315 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 KMOO15229 486 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 RECKO95980 971 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 JCHAINP01591 159 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 SLC4A1P02730 911 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 MYBL1P10243 752 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 GJC1P36383 396 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 SSR1P43307 286 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 GBE1Q04446 702 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 LAMB3Q13751 1172 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF569Q5MCW4 686 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 FAM69BQ5VUD6 431 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF787Q6DD87 383 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 CNTD1Q8N815 330 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 GLYATL1Q969I3 302 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 SLC25A23Q9BV35 468 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 THAP2Q9H0W7 228 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 MLXIPLQ9NP71 852 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-203ENST00000372906 EPHA6Q9UF33 1036 aa13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms