RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364472.1

RNU4-38P-201, Transcript of RNA, U4 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU4-38P, Length 129 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU4-38P-201ENST00000364472 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 GP5P40197 560 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 MPLP40238 635 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 CCNFP41002 786 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 NBL1P41271 181 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 DPP6P42658 865 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 NSG1P42857 185 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 SLC1A2P43004 574 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 PTGER3P43115 390 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 CTSKP43235 329 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 MSH2P43246 934 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 ABCG1P45844 678 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 GPR1P46091 355 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 RABIFP47224 123 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 RXRGP48443 463 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 CD151P48509 253 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 POLD2P49005 469 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 TTPAP49638 278 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 SERPINB9P50453 376 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 CLCN7P51798 805 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 CLCNKAP51800 687 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 THOP1P52888 689 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 PGGT1BP53609 377 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 CTSCP53634 463 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 CDKN2DP55273 166 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 CLDN2P57739 230 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 TAS2R39P59534 338 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 KIAA1024LP59773 190 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 RAB10P61026 200 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 YPEL5P62699 121 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 RACK1P63244 317 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 ARHGAP8P85298 464 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 TMPRSS15P98073 1019 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 B4GALNT1Q00973 533 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 POU4F1Q01851 419 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 BNC1Q01954 994 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 GSTM4Q03013 218 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 SLC18A2Q05940 514 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 DMPKQ09013 629 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 MGAT5Q09328 741 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 OVGP1Q12889 678 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 GRIK2Q13002 908 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 RPA4Q13156 261 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 DNAJC3Q13217 504 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 SGCGQ13326 291 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 CTBP1Q13363 440 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 NAB1Q13506 487 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 ITGA9Q13797 1035 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 SEPT6Q14141 434 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 PTK2BQ14289 1009 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 FZD2Q14332 565 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 NFE2L1Q14494 772 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 SLC29A2Q14542 456 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 GBX1Q14549 363 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 ZNF460Q14592 562 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 INPP5AQ14642 412 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 STAT4Q14765 748 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 LRRC14Q15048 493 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 SHBQ15464 509 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 DBN1Q16643 649 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 LONRF1Q17RB8 773 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 DUOXA1Q1HG43 343 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 SKIDA1Q1XH10 827 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 ZNF423Q2M1K9 1284 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 ALG11Q2TAA5 492 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 KIF19Q2TAC6 998 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 KLHL38Q2WGJ6 581 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 PLK5Q496M5 336 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 MAP9Q49MG5 647 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 BCL7AQ4VC05 210 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 PYCR3Q53H96 274 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 ZNF789Q5FWF6 425 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 TECRLQ5HYJ1 363 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 WDR45BQ5MNZ6 344 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 PLA2G2CQ5R387 149 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 LDLRAP1Q5SW96 308 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 CEP85LQ5SZL2 805 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 GRTP1Q5TC63 336 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 AGBL2Q5U5Z8 902 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU4-38P-201ENST00000364472 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms