RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362830.1

RNU6-223P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 223, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-223P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-223P-201ENST00000362830 TRAT1Q6PIZ9 186 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 MON1BQ7L1V2 547 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLFN11Q7Z7L1 901 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 CEP57Q86XR8 500 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 TC2NQ8N9U0 490 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 MIGA1Q8NAN2 632 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 OLFM1Q99784 485 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 NOX4Q9NPH5 578 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 HACL1Q9UJ83 578 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 FBXW11Q9UKB1 542 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 CDC14AQ9UNH5 594 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 PROCRQ9UNN8 238 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF148Q9UQR1 794 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 TRBC2A0A5B9 178 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 MAGEB17A8MXT2 336 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF217O75362 1048 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 GPC4O75487 556 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 MTA2O94776 668 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 GGPS1O95749 300 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 RPN1P04843 607 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 TPOP07202 933 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 HRH2P25021 359 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 NMBRP28336 390 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 HOXC9P31274 260 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 TFAP4Q01664 338 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 ST3GAL1Q11201 340 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 SCARB2Q14108 478 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 NEDD9Q14511 834 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 PSMD6Q15008 389 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 LETM2Q2VYF4 491 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 KRBOX4Q5JUW0 171 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 C6orf163Q5TEZ5 329 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 FAM69BQ5VUD6 431 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 GGNBP1Q5YKI7 109 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMEM211Q6ICI0 200 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 CAMKMTQ7Z624 323 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 MCEMP1Q8IX19 187 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 XXYLT1Q8NBI6 393 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 ACVR1CQ8NER5 493 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 CFAP61Q8NHU2 1237 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZFAND2BQ8WV99 257 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 LPGAT1Q92604 370 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 RMDN1Q96DB5 314 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 HARBI1Q96MB7 349 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 SMC6Q96SB8 1091 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 DDOQ99489 341 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 TM6SF1Q9BZW5 370 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 KCNK15Q9H427 330 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 MAGIXQ9H6Y5 334 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 DNAJC18Q9H819 358 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 A6NL46 340 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 HEPACAM2A8MVW5 462 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 FAM90A26D6RGX4 464 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 ASAP2O43150 1006 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC7A4O43246 635 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 WISP2O76076 250 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 FYNP06241 537 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 PRSS2P07478 247 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 QDPRP09417 244 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 MYBL1P10243 752 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 ACTN1P12814 892 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 MXI1P50539 228 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 BNC1Q01954 994 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 TROAPQ12815 778 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 TRAF3Q13114 568 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 NFATC4Q14934 902 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 KLHL26Q53HC5 615 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 DCAF6Q58WW2 860 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 TCP11X2Q5H9J9 407 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC36A4Q6YBV0 504 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-223P-201ENST00000362830 MFSD6Q6ZSS7 791 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms