RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 FGF18O76093 207 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 ATP6V1G2O95670 118 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 GNAZP19086 355 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 HSD17B2P37059 387 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 HSPA7P48741 367 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 RHAGQ02094 409 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 HEPACAMQ14CZ8 416 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF792Q3KQV3 632 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 TXNDC8Q6A555 127 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 FBXW8Q8N3Y1 598 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF461Q8TAF7 563 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 CPT1BQ92523 772 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 NXNL1Q96CM4 212 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 KCNS3Q9BQ31 491 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 DNM1LO00429 736 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 FFAR2O15552 330 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 ADSSP30520 456 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 LIMK2P53671 638 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 TRAF3Q13114 568 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 UBR7Q8N806 425 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 UXS1Q8NBZ7 420 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 BTBD1Q9H0C5 482 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 OR2AG1Q9H205 316 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 PTGFRNQ9P2B2 879 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 SNX10Q9Y5X0 201 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 GRIN2DO15399 1336 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 FAM86C2PA6NEL3 165 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 TMED10P49755 219 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 RNF43Q68DV7 783 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 ENPP7Q6UWV6 458 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 PROSER1Q86XN7 944 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 RIT1Q92963 219 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 MYDGFQ969H8 173 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 RCN3Q96D15 328 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 NUS1Q96E22 293 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 CDC14AQ9UNH5 594 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 UGT2B17O75795 530 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 ZMPSTE24O75844 475 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 TGDSO95455 350 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 TBX18O95935 607 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 IL6P05231 212 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 LCP2Q13094 533 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 GPR17Q13304 367 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 DGUOKQ16854 277 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 HGSNATQ68CP4 663 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 CLHC1Q8NHS4 586 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 PYDC1Q8WXC3 89 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 PBX1P40424 430 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 MTHFRP42898 656 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 BRAT1Q6PJG6 821 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 NUAK2Q9H093 628 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 RNF39Q9H2S5 420 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 CNTN3Q9P232 1028 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 INPPL1O15357 1258 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 NRP2O60462 931 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 NOL4O94818 638 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 PRR5P85299 388 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 KLHL12Q53G59 568 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 FAM129CQ86XR2 697 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 AZIN2Q96A70 460 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 DZANK1Q9NVP4 752 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 ERVK-11Q9UQG0 969 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 NR2E1Q9Y466 385 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 A0A0U1RQJ8 604 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 GIMD1P0DJR0 217 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 KCNE1P15382 129 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 EML3Q32P44 896 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 MZT2AQ6P582 158 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 MIEF2Q96C03 454 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 RAD9AQ99638 391 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 CDADC1Q9BWV3 514 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 A0A0J9YYE9 177 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 ENPP3O14638 875 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 STAT5AP42229 794 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 SLC11A1P49279 550 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 JAM2P57087 298 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 AMZ1Q400G9 498 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 CALML5Q9NZT1 146 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRO-202ENST00000348962 IL36AQ9UHA7 158 aa15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms