RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315480.8

USP20-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP20, Length 4,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-201ENST00000315480 FOXM1Q08050 763 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 INCA1Q0VD86 236 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 CHIT1Q13231 466 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 HEPACAMQ14CZ8 416 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 ARSIQ5FYB1 569 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 C10orf107Q8IVU9 208 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 CLEC4CQ8WTT0 213 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 KLK6Q92876 244 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 FNDC11Q9BVV2 318 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 OR2AG1Q9H205 316 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 ZNF180Q9UJW8 692 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 PDE5AO76074 875 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 LRATO95237 230 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 TYRP14679 529 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 ZNF30P17039 623 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 NT5EP21589 574 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 EPHA3P29320 983 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 LGALS3BPQ08380 585 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 BADQ92934 168 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 GMEB2Q9UKD1 530 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 SHPRHQ149N8 1683 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-201ENST00000315480 COX4I1P13073 169 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 PSMB9P28065 219 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 ZNF132P52740 706 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 MAPK12P53778 367 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 ITGA1P56199 1179 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 C2orf80Q0P641 193 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 LCP2Q13094 533 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 LY6G5CQ5SRR4 150 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 TMC8Q8IU68 726 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 SLC35F5Q8WV83 523 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 MTERF3Q96E29 417 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 GSDMCQ9BYG8 508 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 ERVK-5Q9HDB9 667 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 PIGVQ9NUD9 493 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 C3orf18Q9UK00 162 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 PSMD13Q9UNM6 376 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 STYXL1Q9Y6J8 313 aa12.9□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 AKAP12Q02952 1782 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 OR1F1O43749 312 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 TFPIP10646 304 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 IDH2P48735 452 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 KCNQ1P51787 676 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 TNK2Q07912 1038 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 TIGD2Q4W5G0 525 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 SMYD1Q8NB12 490 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 RACGAP1Q9H0H5 632 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 DNAJC28Q9NX36 388 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 COPG2Q9UBF2 871 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 C9J4A7 227 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 PPEF2O14830 753 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 PIAS1O75925 651 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 CBX6O95503 412 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 LAMP2P13473 410 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 AVPR1BP47901 424 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 HSPA7P48741 367 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 OASLQ15646 514 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 IZUMO2Q6UXV1 221 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 OFCC1Q8IZS5 231 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 SLC43A3Q8NBI5 491 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 FAM46DQ8NEK8 389 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 TTLQ8NG68 377 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 ZNF563Q8TA94 476 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 RORBQ92753 470 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 RIT1Q92963 219 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 NXNL1Q96CM4 212 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 Q96MT0 163 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 TWNKQ96RR1 684 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 HCN3Q9P1Z3 774 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 BBIP1A8MTZ0 92 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 UBXN7O94888 489 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 TGDSO95455 350 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 DLDP09622 509 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 RABGGTBP53611 331 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 NR1D2Q14995 579 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 KBTBD6Q86V97 674 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 LRRC57Q8N9N7 239 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 AZIN2Q96A70 460 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 HIC2Q96JB3 615 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 ANKRD27Q96NW4 1050 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 TMEM150CB9EJG8 249 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 MCIDASD6RGH6 385 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 MAN2B1O00754 1011 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 SUV39H1O43463 412 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 OR6B1O95007 311 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 TNFP01375 233 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
USP20-201ENST00000315480 FAM58BPP0C7Q3 252 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms