RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC6A19Q695T7 634 aa15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 POLNQ7Z5Q5 900 aa15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 AOPEPQ8N6M6 819 aa15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 CSPG4P5Q96PW8 444 aa15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 WDR24Q96S15 920 aa15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 CARD9Q9H257 536 aa15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM83DQ9H4H8 585 aa15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 ARFGAP3Q9NP61 516 aa15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 EPHA6Q9UF33 1036 aa15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 RARRES3Q9UL19 164 aa15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa15.89■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 PDZK1P1A8MUH7 402 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 MTA2O94776 668 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 CBX6O95503 412 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 IL1R2P27930 398 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 CAPZBP47756 277 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 UBXN1Q04323 297 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 NR6A1Q15406 480 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 DPYSL2Q16555 572 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 INSCQ1MX18 579 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 CRTC3Q6UUV7 619 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM92BQ6ZTR7 304 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 RUFY1Q96T51 708 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 MFRPQ9BY79 579 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 FANCLQ9NW38 375 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 PKD2L2Q9NZM6 624 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 LUZP4Q9P127 313 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.88■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 TIAF1O95411 115 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 ATP1A3P13637 1013 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 CA4P22748 312 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC19A1P41440 591 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 SPINT3P49223 89 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 RPS18P62269 152 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 TUBB3Q13509 450 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 IL10RAQ13651 578 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 LAMB3Q13751 1172 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 IRGCQ6NXR0 463 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 LUZP1Q86V48 1076 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 TEX26Q8N6G2 289 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 CCHCR1Q8TD31 782 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 RSC1A1Q92681 617 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF653Q96CK0 615 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 RAB33BQ9H082 229 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 OR2AG1Q9H205 316 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 POT1Q9NUX5 634 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa15.87■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 LGALS16A8MUM7 142 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 GPR89AB7ZAQ6 455 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 GPR89BP0CG08 455 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 TCF4P15884 667 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 PCK1P35558 622 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 PTGIRP43119 386 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 ACY1Q03154 408 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 IHHQ14623 411 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 IQCKQ8N0W5 287 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 FDCSPQ8NFU4 85 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 UBXN4Q92575 508 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 SEMA5BQ9P283 1151 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 SCINQ9Y6U3 715 aa15.86■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 OTOGQ6ZRI0 2925 aa15.85■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 ANKUB1A6NFN9 424 aa15.85■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 PRLP01236 227 aa15.85■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 FTLP02792 175 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 RARAP10276 462 aa15.85■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 MYL5Q02045 173 aa15.85■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 KRT81Q14533 505 aa15.85■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 BOLA3Q53S33 107 aa15.85■□□□□ 0.13
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF569Q5MCW4 686 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms