RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262225.7

TMED2-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED2, Length 2,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED2-201ENST00000262225 SNX32Q86XE0 403 aa22.96■■□□□ 1.27
TMED2-201ENST00000262225 GPSM1Q86YR5 675 aa22.96■■□□□ 1.27
TMED2-201ENST00000262225 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TMED2-201ENST00000262225 NXPE1Q8N323 547 aa22.96■■□□□ 1.27
TMED2-201ENST00000262225 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.96■■□□□ 1.27
TMED2-201ENST00000262225 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.96■■□□□ 1.27
TMED2-201ENST00000262225 SCN8AQ9UQD0 1980 aa22.95■■□□□ 1.27
TMED2-201ENST00000262225 A0A088AWK7 358 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 CTSLP07711 333 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 ADH5P11766 374 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.263e-12■□□□□ 8.2
TMED2-201ENST00000262225 DGKGP49619 791 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 RAP1GDS1P52306 607 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 TTC1Q99614 292 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 HEPHQ9BQS7 1158 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 ZBTB26Q9HCK0 441 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 GNPTGQ9UJJ9 305 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 WASH3PC4AMC7 463 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 ITGAXP20702 1163 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 CLYBLQ8N0X4 340 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 ARHGAP24Q8N264 748 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 STON2Q8WXE9 905 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 EBF3Q9H4W6 596 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 CD274Q9NZQ7 290 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 SLC7A8Q9UHI5 535 aa22.95■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 PRDX6P30041 224 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 TGFBIQ15582 683 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 ANKS6Q68DC2 871 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 PELI3Q8N2H9 469 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 C19orf43Q9BQ61 176 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 SZT2Q5T011 3432 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 AIM2O14862 343 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 KLK8O60259 260 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 GPR33Q49SQ1 333 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 AGAP14A8MT82 685 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 NNMTP40261 264 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 SLC6A11P48066 632 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 INHBCP55103 352 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 SATB1Q01826 763 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 DEFB107AQ8IZN7 70 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 SNX31Q8N9S9 440 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 ACTRT2Q8TDY3 377 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 CEP290O15078 2479 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 RPS17P08708 135 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 THRAP10827 490 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 SPINT3P49223 89 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 GIMAP2Q9UG22 337 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 AZIN1O14977 448 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 SNX2O60749 519 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 TULP3O75386 442 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 FGF4P08620 206 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 POU2F2P09086 479 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 B4GALNT1Q00973 533 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 DUSP6Q16828 381 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 RTKNQ9BST9 563 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 IGFLR1Q9H665 355 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 CHSY3Q70JA7 882 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 PLPP6Q8IY26 295 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 FGF13Q92913 245 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 SCAMP4Q969E2 229 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 NXPE3Q969Y0 559 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 C19orf60Q96EN9 201 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 PANX3Q96QZ0 392 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 TUBB1Q9H4B7 451 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 ZNF225Q9UK10 706 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 PCTPQ9UKL6 214 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 TIMM22Q9Y584 194 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.91■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 STX16O14662 325 aa22.91■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 LCP2Q13094 533 aa22.91■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 SBSNQ6UWP8 590 aa22.91■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 MACC1Q6ZN28 852 aa22.91■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
TMED2-201ENST00000262225 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
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