RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 TSHRP16473 764 aa6.51□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 RAB30Q15771 203 aa6.51□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.51□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.51□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 CD200R1Q8TD46 325 aa6.51□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 AP2M1Q96CW1 435 aa6.51□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 KCNK12Q9HB15 430 aa6.51□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 IL36AQ9UHA7 158 aa6.51□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.51□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 IGLON5A6NGN9 336 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 NFATC1O95644 943 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 EGFP01133 1207 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 GSTA2P09210 222 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 CCR7P32248 378 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 HSPA7P48741 367 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 PRKG2Q13237 762 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 CYS1Q717R9 158 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 HIPK4Q8NE63 616 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 CATSPER2Q96P56 530 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 S1PR5Q9H228 398 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 STK25O00506 426 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 FCHO1O14526 889 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 GSTA1P08263 222 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 T-ENOLP0DO92 83 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 CD1DP15813 335 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 SCTRP47872 440 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 SPINT3P49223 89 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 RASA2Q15283 850 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 TIFABQ6ZNK6 161 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 C3orf30Q96M34 536 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 OXSMQ9NWU1 459 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 HACD3Q9P035 362 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 RNF112Q9ULX5 631 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 TARM1B6A8C7 271 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 SPINT1O43278 529 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 ECI2O75521 394 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 COL9A1P20849 921 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 CLDN2P57739 230 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 SH3BP2P78314 561 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 LIPIQ6XZB0 460 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 USP45Q70EL2 814 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 PGBD3Q8N328 593 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 CALML6Q8TD86 181 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 EGFL8Q99944 293 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 OR2AG1Q9H205 316 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 CD248Q9HCU0 757 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 FFAR2O15552 330 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 TSPAN12O95859 305 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 STATHP02808 62 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 POU4F1Q01851 419 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 AADATQ8N5Z0 425 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.5□□□□□ -1.37
CNIH1-201ENST00000216416 CD274Q9NZQ7 290 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms