RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GnasQ6R0H7 1133 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam185aQ7TPD2 378 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zswim6Q80TB7 1207 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vipas39Q8BGQ1 491 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Msantd1Q8BIL2 278 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr26Q8BZA7 337 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scara3Q8C850 606 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1Q8VGI1 314 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chst15Q91XQ5 561 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tcaf2Q921K8 919 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcyt2Q922E4 404 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sike1Q9CPR7 207 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sar1bQ9CQC9 198 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Msantd3Q9CR78 275 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nif3l1Q9EQ80 376 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc13a1Q9JHI4 594 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RgrQ9Z2B3 291 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gipc2Q9Z2H7 314 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm43796A0A0J9YV32 372 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slfn3A0A1L1STQ7 640 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp871G5E905 615 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P01670 111 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P01671 111 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P01672 111 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ClgnP52194 611 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pip5k1bP70181 539 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rtel1Q0VGM9 1203 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc30a10Q3UVU3 470 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Taar7bQ5QD11 358 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Map3k3Q61084 626 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phc1Q64028 1012 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrtm4Q80XG9 590 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dupd1Q8BK84 215 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Efemp1Q8BPB5 493 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 B4gat1Q8BWP8 415 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fmo9Q8C116 539 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam228aQ8CDW1 299 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sash3Q8K352 380 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 4930524N10RikQ9D519 233 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmed2Q9R0Q3 201 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp599E9PWP1 548 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxl18E9PYR1 771 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arl9F7BE40 171 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fcgr3P08508 261 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pde7aP70453 456 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdk16Q04735 496 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nfatc2Q60591 927 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Irak1Q62406 710 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arl13bQ640N2 427 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Far2Q7TNT2 515 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Orai2Q8BH10 250 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tyw1Q8BJM7 721 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pdcl3Q8BVF2 240 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lats1Q8BYR2 1129 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxo48Q8CAT8 161 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Evi2bQ8VD58 444 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpn2Q8VEJ1 310 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ApmapQ9D7N9 415 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc103Q9D9P2 237 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Opn4Q9QXZ9 521 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gbp4A4UUI3 631 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3259D3YUK0 475 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scgb2b7D3YYY1 112 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Morc3F7BJB9 942 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnfrsf11bO08712 401 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 IkbkgO88522 412 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Msh2P43247 935 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ApodP51910 189 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gucy2eP52785 1108 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ranbp9P69566 653 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbx1P70323 479 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttyh2Q3TH73 532 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 StimateQ3UF25 288 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnf224Q3UIW8 156 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Marveld2Q3UZP0 555 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr48Q8BH57 676 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 VitQ8VHI5 650 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ucn3Q924A4 164 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrm1Q99J25 320 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem80Q9D3H0 123 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cnbd2Q9D5U8 673 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnajb8Q9QYI7 227 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lama1P19137 3084 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc121E9Q6D3 323 aa22.41■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 HcrtO55241 130 aa22.41■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pdx1P52946 284 aa22.41■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pms2P54279 859 aa22.41■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxo40P62932 710 aa22.41■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam83fQ3UKU4 495 aa22.41■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbl2Q64700 1135 aa22.41■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf516Q7TSH3 1157 aa22.41■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stkld1Q80YS9 662 aa22.41■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrpl22Q8BU88 206 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 C1qtnf7Q8BVD7 289 aa22.41■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stx19Q8R1Q0 292 aa22.41■■□□□ 1.18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zc3h10Q8R205 435 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.8 ms