RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATG3	Q9NT62	314 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TNNT1	P13805	278 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CTR9	Q6PD62	1173 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TPM3	P06753	285 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BANK1	Q8NDB2	785 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USP26	Q9BXU7	913 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	10.51	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PTGS1	P23219	599 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GTF3C6	Q969F1	213 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ERBB3	P21860	1342 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BRD1	O95696	1058 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TOMM22	Q9NS69	142 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NUP155	O75694	1391 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CDC45	O75419	566 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ELF2	Q15723	593 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	10.49	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CEP83	Q9Y592	693 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LAMC1	P11047	1609 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RAD50	Q92878	1312 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LRMP	Q12912	555 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC172	P0C7W6	258 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	WDR63	Q8IWG1	891 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KANK1	Q14678	1352 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PTPRC	P08575	1304 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USP48	Q86UV5	1035 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GPATCH11	Q8N954	259 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IFT57	Q9NWB7	429 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLA2G4A	P47712	749 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADGRL2	O95490	1459 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ST18	O60284	1047 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SYNM	O15061	1565 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MX1	P20591	662 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ST5	P78524	1137 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RGL3	Q3MIN7	710 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DRC1	Q96MC2	740 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CEP135	Q66GS9	1140 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SRL	Q86TD4	932 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF592	Q92610	1267 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RAPGEF3	O95398	923 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZSCAN26	Q16670	478 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SMARCE1	Q969G3	411 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ERO1A	Q96HE7	468 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	A2M	P01023	1474 aa		10.44	□□□□□ -0.74

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