RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 POLKQ9UBT6 870 aa39.78■■■■□ 3.96
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SEMA3B-215ENST00000621029 KIF7Q2M1P5 1343 aa39.74■■■■□ 3.95
SEMA3B-215ENST00000621029 LRP5O75197 1615 aa39.73■■■■□ 3.95
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SEMA3B-215ENST00000621029 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
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SEMA3B-215ENST00000621029 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa39.65■■■■□ 3.94
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SEMA3B-215ENST00000621029 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
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SEMA3B-215ENST00000621029 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
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SEMA3B-215ENST00000621029 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
SEMA3B-215ENST00000621029 PKD1L3Q7Z443 1732 aa39.41■■■■□ 3.9
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SEMA3B-215ENST00000621029 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa39.36■■■■□ 3.89
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SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
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SEMA3B-215ENST00000621029 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
SEMA3B-215ENST00000621029 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
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SEMA3B-215ENST00000621029 C1orf141Q5JVX7 400 aa39.22■■■■□ 3.87
SEMA3B-215ENST00000621029 ITGB4P16144 1822 aa39.21■■■■□ 3.87
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC16A10Q8TF71 515 aa39.2■■■■□ 3.87
SEMA3B-215ENST00000621029 DCAF5Q96JK2 942 aa39.2■■■■□ 3.87
SEMA3B-215ENST00000621029 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
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SEMA3B-215ENST00000621029 DCAF8L1A6NGE4 600 aa39.16■■■■□ 3.86
SEMA3B-215ENST00000621029 ERVV-2B6SEH9 535 aa39.16■■■■□ 3.86
SEMA3B-215ENST00000621029 KDRP35968 1356 aa39.16■■■■□ 3.86
SEMA3B-215ENST00000621029 ARXQ96QS3 562 aa39.15■■■■□ 3.86
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SEMA3B-215ENST00000621029 POLD1P28340 1107 aa39.12■■■■□ 3.85
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SEMA3B-215ENST00000621029 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
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SEMA3B-215ENST00000621029 FLAD1Q8NFF5 587 aa39.07■■■■□ 3.85
SEMA3B-215ENST00000621029 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa39.07■■■■□ 3.84
SEMA3B-215ENST00000621029 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
SEMA3B-215ENST00000621029 KLHL34Q8N239 644 aa39.06■■■■□ 3.84
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