RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620944.4

NME4-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-211ENST00000620944 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
NME4-211ENST00000620944 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.77■■■□□ 2.36
NME4-211ENST00000620944 MORC1Q86VD1 984 aa29.76■■■□□ 2.35
NME4-211ENST00000620944 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
NME4-211ENST00000620944 NHSQ6T4R5 1651 aa29.76■■■□□ 2.35
NME4-211ENST00000620944 TXNRD1Q16881 649 aa29.75■■■□□ 2.35
NME4-211ENST00000620944 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.75■■■□□ 2.35
NME4-211ENST00000620944 PROM2Q8N271 834 aa29.72■■■□□ 2.35
NME4-211ENST00000620944 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.71■■■□□ 2.35
NME4-211ENST00000620944 LRP5O75197 1615 aa29.71■■■□□ 2.35
NME4-211ENST00000620944 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.71■■■□□ 2.35
NME4-211ENST00000620944 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.71■■■□□ 2.35
NME4-211ENST00000620944 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
NME4-211ENST00000620944 STK32BQ9NY57 414 aa29.69■■■□□ 2.34
NME4-211ENST00000620944 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
NME4-211ENST00000620944 EYA1Q99502 592 aa29.67■■■□□ 2.34
NME4-211ENST00000620944 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
NME4-211ENST00000620944 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
NME4-211ENST00000620944 SPG7Q9UQ90 795 aa29.64■■■□□ 2.34
NME4-211ENST00000620944 BTAF1O14981 1849 aa29.62■■■□□ 2.33
NME4-211ENST00000620944 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
NME4-211ENST00000620944 NCAPD2Q15021 1401 aa29.62■■■□□ 2.33
NME4-211ENST00000620944 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.6■■■□□ 2.33
NME4-211ENST00000620944 SLC15A2Q16348 729 aa29.6■■■□□ 2.33
NME4-211ENST00000620944 SPON1Q9HCB6 807 aa29.6■■■□□ 2.33
NME4-211ENST00000620944 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.59■■■□□ 2.33
NME4-211ENST00000620944 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.59■■■□□ 2.33
NME4-211ENST00000620944 CYP27B1O15528 508 aa29.58■■■□□ 2.33
NME4-211ENST00000620944 SLC27A3Q5K4L6 730 aa29.58■■■□□ 2.33
NME4-211ENST00000620944 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
NME4-211ENST00000620944 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.32
NME4-211ENST00000620944 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
NME4-211ENST00000620944 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.54■■■□□ 2.32
NME4-211ENST00000620944 LRRC4BQ9NT99 713 aa29.54■■■□□ 2.32
NME4-211ENST00000620944 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
NME4-211ENST00000620944 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa29.53■■■□□ 2.32
NME4-211ENST00000620944 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
NME4-211ENST00000620944 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.51■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 ZBTB7AO95365 584 aa29.5■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.5■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 KCNQ4P56696 695 aa29.48■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 ZNF827Q17R98 1081 aa29.48■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.48■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 MTHFSP49914 203 aa29.47■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 PAPPAQ13219 1627 aa29.46■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 PHKG2P15735 406 aa29.46■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa29.45■■■□□ 2.31
NME4-211ENST00000620944 PALLDQ8WX93 1383 aa29.44■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.44■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 TMOD3Q9NYL9 352 aa29.44■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 CASZ1Q86V15 1759 aa29.44■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.43■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 IL13P35225 146 aa29.43■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 AMOTQ4VCS5 1084 aa29.43■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.43■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 AKT1S1Q96B36 256 aa29.43■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 MTFR1LQ9H019 292 aa29.43■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 PIGBQ92521 554 aa29.42■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 C1orf141Q5JVX7 400 aa29.39■■■□□ 2.3
NME4-211ENST00000620944 LY75O60449 1722 aa29.37■■■□□ 2.29
NME4-211ENST00000620944 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.37■■■□□ 2.29
NME4-211ENST00000620944 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
NME4-211ENST00000620944 DCAF5Q96JK2 942 aa29.37■■■□□ 2.29
NME4-211ENST00000620944 KDRP35968 1356 aa29.36■■■□□ 2.29
NME4-211ENST00000620944 MSH5O43196 834 aa29.34■■■□□ 2.29
NME4-211ENST00000620944 PTGER2P43116 358 aa29.34■■■□□ 2.29
NME4-211ENST00000620944 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.34■■■□□ 2.29
NME4-211ENST00000620944 ERVV-2B6SEH9 535 aa29.32■■■□□ 2.28
NME4-211ENST00000620944 HMOX1P09601 288 aa29.32■■■□□ 2.28
NME4-211ENST00000620944 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.32■■■□□ 2.28
NME4-211ENST00000620944 ASAP1Q9ULH1 1129 aa29.31■■■□□ 2.28
NME4-211ENST00000620944 CABP4P57796 275 aa29.3■■■□□ 2.28
NME4-211ENST00000620944 ITGB4P16144 1822 aa29.29■■■□□ 2.28
NME4-211ENST00000620944 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa29.29■■■□□ 2.28
NME4-211ENST00000620944 DCAF8L1A6NGE4 600 aa29.29■■■□□ 2.28
NME4-211ENST00000620944 SIK1P57059 783 aa29.29■■■□□ 2.28
NME4-211ENST00000620944 AK7Q96M32 723 aa29.29■■■□□ 2.28
NME4-211ENST00000620944 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
NME4-211ENST00000620944 POLD1P28340 1107 aa29.28■■■□□ 2.28
NME4-211ENST00000620944 CFAP53Q96M91 514 aa29.28■■■□□ 2.28
NME4-211ENST00000620944 ARXQ96QS3 562 aa29.26■■■□□ 2.27
NME4-211ENST00000620944 ATG3Q9NT62 314 aa29.26■■■□□ 2.27
NME4-211ENST00000620944 C5P01031 1676 aa29.25■■■□□ 2.27
NME4-211ENST00000620944 ATP6V1AP38606 617 aa29.25■■■□□ 2.27
NME4-211ENST00000620944 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.25■■■□□ 2.27
NME4-211ENST00000620944 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.25■■■□□ 2.27
NME4-211ENST00000620944 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
NME4-211ENST00000620944 AKAP4Q5JQC9 854 aa29.24■■■□□ 2.27
NME4-211ENST00000620944 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
NME4-211ENST00000620944 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.23■■■□□ 2.27
NME4-211ENST00000620944 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
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