RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596559.5

ZNF28-208, Transcript of zinc finger protein 28, human

TSL 5

Gene ZNF28, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF28-208	ENST00000596559	HSPA1L	P34931	641 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	GRM5	P41594	1212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	ARID5B	Q14865	1188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	MADD	Q8WXG6	1647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	CUL7	Q14999	1698 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	CDC14C	A4D256	554 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	FURIN	P09958	794 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF28-208	ENST00000596559	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	FOXJ1	Q92949	421 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	BCAN	Q96GW7	911 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	BTBD11	A6QL63	1104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	C6orf229	H3BNL8	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	TOM1	O60784	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	GAS6	Q14393	721 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	PTPRT	O14522	1441 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	FDX1	P10109	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	PODN	Q7Z5L7	613 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	SPINT1	O43278	529 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	FSHR	P23945	695 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	IGF1R	P08069	1367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	ITGB7	P26010	798 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	PRR7	Q8TB68	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559		Q6ZVU0	165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	FANCA	O15360	1455 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ZNF28-208	ENST00000596559	STRC	Q7RTU9	1775 aa		4.53	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.53	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	BCR	P11274	1271 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	CTH	P32929	405 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	CBLB	Q13191	982 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	MBIP	Q9NS73	344 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	AGER	Q15109	404 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	P3H3	Q8IVL6	736 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	DISP1	Q96F81	1524 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	MAP2K5	Q13163	448 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	LYPD8	Q6UX82	237 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	ACD	Q96AP0	544 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	MAP10	Q9P2G4	905 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	NEO1	Q92859	1461 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	MTMR2	Q13614	643 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ZNF28-208	ENST00000596559	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.49	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms