RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
ZNF548-204ENST00000594693 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC184Q52MB2 194 aa23.6■■□□□ 1.37
ZNF548-204ENST00000594693 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.6■■□□□ 1.37
ZNF548-204ENST00000594693 FCHSD2O94868 740 aa23.59■■□□□ 1.37
ZNF548-204ENST00000594693 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ZNF548-204ENST00000594693 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ZNF548-204ENST00000594693 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.57■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 SPG7Q9UQ90 795 aa23.57■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 TNS2Q63HR2 1409 aa23.57■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.56■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 FAM182BQ5T319 152 aa23.55■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.54■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 LRRC37A3O60309 1634 aa23.54■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 CYP27B1O15528 508 aa23.53■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 PRKAR2BP31323 418 aa23.53■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.53■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 MRS2Q9HD23 443 aa23.52■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.52■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.52■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.52■■□□□ 1.36
ZNF548-204ENST00000594693 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ZNF548-204ENST00000594693 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.51■■□□□ 1.35
ZNF548-204ENST00000594693 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.51■■□□□ 1.35
ZNF548-204ENST00000594693 BCL9O00512 1426 aa23.5■■□□□ 1.35
ZNF548-204ENST00000594693 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
ZNF548-204ENST00000594693 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ZNF548-204ENST00000594693 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ZNF548-204ENST00000594693 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.49■■□□□ 1.35
ZNF548-204ENST00000594693 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ZNF548-204ENST00000594693 PHKG2P15735 406 aa23.48■■□□□ 1.35
ZNF548-204ENST00000594693 MIER1Q8N108 512 aa23.48■■□□□ 1.35
ZNF548-204ENST00000594693 CCER2I3L3R5 266 aa23.47■■□□□ 1.35
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ZNF548-204ENST00000594693 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.45■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 EP400Q96L91 3159 aa23.43■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.43■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.43■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 TRIM37O94972 964 aa23.41■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 NEFMP07197 916 aa23.41■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC125Q86Z20 511 aa23.41■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 RUNDC1Q96C34 613 aa23.41■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 DCAF5Q96JK2 942 aa23.4■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ZNF548-204ENST00000594693 KCNQ2O43526 872 aa23.39■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.39■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.39■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.38■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.38■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.37■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.37■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.36■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 NFE2L2Q16236 605 aa23.36■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 LGR6Q9HBX8 967 aa23.36■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 SOCS7O14512 581 aa23.35■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.34■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 IL17REQ8NFR9 667 aa23.34■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 MAP3K5Q99683 1374 aa23.34■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ZNF548-204ENST00000594693 APBA3O96018 575 aa23.31■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 RIPK4P57078 832 aa23.31■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 PIGBQ92521 554 aa23.31■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 APAF1O14727 1248 aa23.3■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 SBF2Q86WG5 1849 aa23.29■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 CABP4P57796 275 aa23.29■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.29■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.28■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 PLSCR1O15162 318 aa23.28■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.28■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.28■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 MCM10Q7L590 875 aa23.27■■□□□ 1.32
ZNF548-204ENST00000594693 DCTN1Q14203 1278 aa23.26■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 NEUROD2Q15784 382 aa23.26■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 NHSQ6T4R5 1651 aa23.25■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 BAG6P46379 1132 aa23.25■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.25■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.25■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.25■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.24■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.24■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.24■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.24■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.23■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 ATG3Q9NT62 314 aa23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms