RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-209ENST00000591760 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa35.34■■■■□ 3.25
PTPRS-209ENST00000591760 ACSBG1Q96GR2 724 aa35.34■■■■□ 3.25
PTPRS-209ENST00000591760 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.33■■■■□ 3.25
PTPRS-209ENST00000591760 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
PTPRS-209ENST00000591760 POLKQ9UBT6 870 aa35.32■■■■□ 3.24
PTPRS-209ENST00000591760 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
PTPRS-209ENST00000591760 KNSTRNQ9Y448 316 aa35.31■■■■□ 3.24
PTPRS-209ENST00000591760 BTAF1O14981 1849 aa35.31■■■■□ 3.24
PTPRS-209ENST00000591760 TATP17735 454 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
PTPRS-209ENST00000591760 DOT1LQ8TEK3 1739 aa35.28■■■■□ 3.24
PTPRS-209ENST00000591760 NCAPD2Q15021 1401 aa35.27■■■■□ 3.24
PTPRS-209ENST00000591760 KAT6BQ8WYB5 2073 aa35.26■■■■□ 3.23
PTPRS-209ENST00000591760 TXNRD1Q16881 649 aa35.23■■■■□ 3.23
PTPRS-209ENST00000591760 MORC1Q86VD1 984 aa35.23■■■■□ 3.23
PTPRS-209ENST00000591760 PROM2Q8N271 834 aa35.23■■■■□ 3.23
PTPRS-209ENST00000591760 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa35.22■■■■□ 3.23
PTPRS-209ENST00000591760 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa35.22■■■■□ 3.23
PTPRS-209ENST00000591760 PKD1L3Q7Z443 1732 aa35.21■■■■□ 3.23
PTPRS-209ENST00000591760 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
PTPRS-209ENST00000591760 EYA1Q99502 592 aa35.17■■■■□ 3.22
PTPRS-209ENST00000591760 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
PTPRS-209ENST00000591760 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
PTPRS-209ENST00000591760 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
PTPRS-209ENST00000591760 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
PTPRS-209ENST00000591760 STK32BQ9NY57 414 aa35.12■■■■□ 3.21
PTPRS-209ENST00000591760 PAPPAQ13219 1627 aa35.11■■■■□ 3.21
PTPRS-209ENST00000591760 SPG7Q9UQ90 795 aa35.1■■■■□ 3.21
PTPRS-209ENST00000591760 CASZ1Q86V15 1759 aa35.1■■■■□ 3.21
PTPRS-209ENST00000591760 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa35.09■■■■□ 3.21
PTPRS-209ENST00000591760 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
PTPRS-209ENST00000591760 IGSF1Q8N6C5 1336 aa35.07■■■■□ 3.21
PTPRS-209ENST00000591760 CYP27B1O15528 508 aa35.07■■■■□ 3.2
PTPRS-209ENST00000591760 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP35.07■■■■□ 3.22e-12■□□□□ 9.3
PTPRS-209ENST00000591760 LY75O60449 1722 aa35.06■■■■□ 3.2
PTPRS-209ENST00000591760 SLC15A2Q16348 729 aa35.06■■■■□ 3.2
PTPRS-209ENST00000591760 SLC27A3Q5K4L6 730 aa35.06■■■■□ 3.2
PTPRS-209ENST00000591760 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa35.04■■■■□ 3.2
PTPRS-209ENST00000591760 SPON1Q9HCB6 807 aa35.01■■■■□ 3.2
PTPRS-209ENST00000591760 LRRC4BQ9NT99 713 aa35.01■■■■□ 3.2
PTPRS-209ENST00000591760 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa35■■■■□ 3.19
PTPRS-209ENST00000591760 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
PTPRS-209ENST00000591760 ITGB4P16144 1822 aa34.99■■■■□ 3.19
PTPRS-209ENST00000591760 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
PTPRS-209ENST00000591760 IFNL2Q8IZJ0 200 aa34.96■■■■□ 3.19
PTPRS-209ENST00000591760 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa34.95■■■■□ 3.19
PTPRS-209ENST00000591760 PHKG2P15735 406 aa34.94■■■■□ 3.18
PTPRS-209ENST00000591760 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
PTPRS-209ENST00000591760 QSER1Q2KHR3 1735 aa34.93■■■■□ 3.18
PTPRS-209ENST00000591760 MTHFSP49914 203 aa34.93■■■■□ 3.18
PTPRS-209ENST00000591760 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
PTPRS-209ENST00000591760 ZNF827Q17R98 1081 aa34.92■■■■□ 3.18
PTPRS-209ENST00000591760 IL13P35225 146 aa34.91■■■■□ 3.18
PTPRS-209ENST00000591760 AKT1S1Q96B36 256 aa34.9■■■■□ 3.18
PTPRS-209ENST00000591760 KDRP35968 1356 aa34.89■■■■□ 3.18
PTPRS-209ENST00000591760 PALLDQ8WX93 1383 aa34.89■■■■□ 3.18
PTPRS-209ENST00000591760 ZBTB7AO95365 584 aa34.89■■■■□ 3.18
PTPRS-209ENST00000591760 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
PTPRS-209ENST00000591760 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
PTPRS-209ENST00000591760 KCNQ4P56696 695 aa34.88■■■■□ 3.17
PTPRS-209ENST00000591760 AMOTQ4VCS5 1084 aa34.88■■■■□ 3.17
PTPRS-209ENST00000591760 AEBP1Q8IUX7 1158 aa34.88■■■■□ 3.17
PTPRS-209ENST00000591760 C5P01031 1676 aa34.87■■■■□ 3.17
PTPRS-209ENST00000591760 SULT6B1Q6IMI4 303 aa34.87■■■■□ 3.17
PTPRS-209ENST00000591760 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
PTPRS-209ENST00000591760 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa34.85■■■■□ 3.17
PTPRS-209ENST00000591760 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
PTPRS-209ENST00000591760 PIGBQ92521 554 aa34.85■■■■□ 3.17
PTPRS-209ENST00000591760 MTFR1LQ9H019 292 aa34.85■■■■□ 3.17
PTPRS-209ENST00000591760 TMOD3Q9NYL9 352 aa34.85■■■■□ 3.17
PTPRS-209ENST00000591760 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
PTPRS-209ENST00000591760 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
PTPRS-209ENST00000591760 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
PTPRS-209ENST00000591760 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa34.82■■■■□ 3.16
PTPRS-209ENST00000591760 TAF1LQ8IZX4 1826 aa34.81■■■■□ 3.16
PTPRS-209ENST00000591760 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
PTPRS-209ENST00000591760 DCAF5Q96JK2 942 aa34.8■■■■□ 3.16
PTPRS-209ENST00000591760 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
PTPRS-209ENST00000591760 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa34.79■■■■□ 3.16
PTPRS-209ENST00000591760 PTGER2P43116 358 aa34.78■■■■□ 3.16
PTPRS-209ENST00000591760 C1orf141Q5JVX7 400 aa34.78■■■■□ 3.16
PTPRS-209ENST00000591760 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
PTPRS-209ENST00000591760 ERVV-2B6SEH9 535 aa34.76■■■■□ 3.16
PTPRS-209ENST00000591760 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
PTPRS-209ENST00000591760 SLC16A10Q8TF71 515 aa34.75■■■■□ 3.15
PTPRS-209ENST00000591760 C4BP0C0L5 1744 aa34.73■■■■□ 3.15
PTPRS-209ENST00000591760 HMOX1P09601 288 aa34.72■■■■□ 3.15
PTPRS-209ENST00000591760 ASAP1Q9ULH1 1129 aa34.71■■■■□ 3.15
PTPRS-209ENST00000591760 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa34.7■■■■□ 3.15
PTPRS-209ENST00000591760 SIK1P57059 783 aa34.7■■■■□ 3.15
PTPRS-209ENST00000591760 SGIP1Q9BQI5 828 aa34.7■■■■□ 3.15
PTPRS-209ENST00000591760 COL24A1Q17RW2 1714 aa34.68■■■■□ 3.14
PTPRS-209ENST00000591760 ATG3Q9NT62 314 aa34.68■■■■□ 3.14
PTPRS-209ENST00000591760 SCN11AQ9UI33 1791 aa34.67■■■■□ 3.14
PTPRS-209ENST00000591760 CABP4P57796 275 aa34.67■■■■□ 3.14
PTPRS-209ENST00000591760 CFAP53Q96M91 514 aa34.67■■■■□ 3.14
PTPRS-209ENST00000591760 AKAP4Q5JQC9 854 aa34.66■■■■□ 3.14
PTPRS-209ENST00000591760 AK7Q96M32 723 aa34.65■■■■□ 3.14
PTPRS-209ENST00000591760 ZNF831Q5JPB2 1677 aa34.65■■■■□ 3.14
PTPRS-209ENST00000591760 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
PTPRS-209ENST00000591760 FLAD1Q8NFF5 587 aa34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms