RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 SLC24A1O60721 1099 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-208ENST00000590422 KCNQ4P56696 695 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-208ENST00000590422 NBPF6Q5VWK0 638 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-208ENST00000590422 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-208ENST00000590422 NBPF4Q96M43 638 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-208ENST00000590422 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CTIF-208ENST00000590422 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 AKT1S1Q96B36 256 aa16.95■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 COL24A1Q17RW2 1714 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 SYT17Q9BSW7 474 aa16.93■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.93■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.93■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa16.93■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 INSRP06213 1382 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 SLC27A3Q5K4L6 730 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 FLT4P35916 1363 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 ARXQ96QS3 562 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-208ENST00000590422 PKD1L3Q7Z443 1732 aa16.9■□□□□ 0.3
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CTIF-208ENST00000590422 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 MAP3K5Q99683 1374 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 C5P01031 1676 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 CDCA8Q53HL2 280 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 CGNL1Q0VF96 1302 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 CHD4Q14839 1912 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 KIF24Q5T7B8 1368 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 ITGB4P16144 1822 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 NCAPD2Q15021 1401 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa16.85■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa16.85■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 CYP27B1O15528 508 aa16.84■□□□□ 0.29
CTIF-208ENST00000590422 SLC16A10Q8TF71 515 aa16.83■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 PALLDQ8WX93 1383 aa16.82■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.81■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 KLHL34Q8N239 644 aa16.81■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.81■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 C4BP0C0L5 1744 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 POLD1P28340 1107 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 UBR3Q6ZT12 1888 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 MSL1Q68DK7 614 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 EYA1Q99502 592 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 POLKQ9UBT6 870 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 AMIGO3Q86WK7 504 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-208ENST00000590422 MSH5O43196 834 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-208ENST00000590422 GPR162Q16538 588 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-208ENST00000590422 PIGBQ92521 554 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-208ENST00000590422 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-208ENST00000590422 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-208ENST00000590422 SMIM5Q71RC9 77 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-208ENST00000590422 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTIF-208ENST00000590422 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTIF-208ENST00000590422 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTIF-208ENST00000590422 SPG7Q9UQ90 795 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-208ENST00000590422 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
CTIF-208ENST00000590422 PHKG2P15735 406 aa16.71■□□□□ 0.27
CTIF-208ENST00000590422 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
CTIF-208ENST00000590422 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 AK7Q96M32 723 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 PANK3Q9H999 370 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 IGSF1Q8N6C5 1336 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 PHF14O94880 888 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 SIK1P57059 783 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 ITPK1Q13572 414 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 KDRP35968 1356 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 IFNL2Q8IZJ0 200 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 FLAD1Q8NFF5 587 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 ATG3Q9NT62 314 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CTIF-208ENST00000590422 SSFA2P28290 1259 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-208ENST00000590422 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-208ENST00000590422 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.64■□□□□ 0.25
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