RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590198.1

ROGDI-212, Transcript of rogdi homolog, humanhuman

TSL 3

Gene ROGDI, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROGDI-212ENST00000590198 SULT6B1Q6IMI4 303 aa41.28■■■■■ 4.2
ROGDI-212ENST00000590198 AEBP1Q8IUX7 1158 aa41.28■■■■■ 4.2
ROGDI-212ENST00000590198 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
ROGDI-212ENST00000590198 EP400Q96L91 3159 aa41.27■■■■■ 4.2
ROGDI-212ENST00000590198 RGPD1P0DJD0 1748 aa41.24■■■■■ 4.19
ROGDI-212ENST00000590198 BCL9O00512 1426 aa41.24■■■■■ 4.19
ROGDI-212ENST00000590198 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
ROGDI-212ENST00000590198 SPG7Q9UQ90 795 aa41.23■■■■■ 4.19
ROGDI-212ENST00000590198 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa41.2■■■■■ 4.19
ROGDI-212ENST00000590198 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa41.2■■■■■ 4.19
ROGDI-212ENST00000590198 HMOX1P09601 288 aa41.2■■■■■ 4.19
ROGDI-212ENST00000590198 DEFB132Q7Z7B7 95 aa41.2■■■■■ 4.19
ROGDI-212ENST00000590198 SHANK3Q9BYB0 1731 aa41.2■■■■■ 4.19
ROGDI-212ENST00000590198 ACSBG1Q96GR2 724 aa41.19■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP41.19■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 KDRP35968 1356 aa41.17■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 BAG6P46379 1132 aa41.17■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 NUDCQ9Y266 331 aa41.17■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 APBA3O96018 575 aa41.16■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 CYP27B1O15528 508 aa41.15■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 PTF1AQ7RTS3 328 aa41.15■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 PKD1L3Q7Z443 1732 aa41.15■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 SBF2Q86WG5 1849 aa41.14■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
ROGDI-212ENST00000590198 KCNQ2O43526 872 aa41.13■■■■■ 4.17
ROGDI-212ENST00000590198 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa41.12■■■■■ 4.17
ROGDI-212ENST00000590198 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
ROGDI-212ENST00000590198 AMOTQ4VCS5 1084 aa41.1■■■■■ 4.17
ROGDI-212ENST00000590198 IFNL2Q8IZJ0 200 aa41.08■■■■■ 4.17
ROGDI-212ENST00000590198 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
ROGDI-212ENST00000590198 PHKG2P15735 406 aa41.06■■■■■ 4.16
ROGDI-212ENST00000590198 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP41.06■■■■■ 4.16
ROGDI-212ENST00000590198 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
ROGDI-212ENST00000590198 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
ROGDI-212ENST00000590198 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
ROGDI-212ENST00000590198 NHSQ6T4R5 1651 aa41.03■■■■■ 4.16
ROGDI-212ENST00000590198 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
ROGDI-212ENST00000590198 KAT6BQ8WYB5 2073 aa41.02■■■■■ 4.16
ROGDI-212ENST00000590198 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
ROGDI-212ENST00000590198 CAMKK2Q96RR4 588 aa41■■■■■ 4.15
ROGDI-212ENST00000590198 DOT1LQ8TEK3 1739 aa40.99■■■■■ 4.15
ROGDI-212ENST00000590198 C1orf141Q5JVX7 400 aa40.98■■■■■ 4.15
ROGDI-212ENST00000590198 RSPH6AQ9H0K4 717 aa40.97■■■■■ 4.15
ROGDI-212ENST00000590198 PRKAR2BP31323 418 aa40.96■■■■■ 4.15
ROGDI-212ENST00000590198 PLSCR1O15162 318 aa40.95■■■■■ 4.15
ROGDI-212ENST00000590198 ANP32CO43423 234 aa40.94■■■■■ 4.14
ROGDI-212ENST00000590198 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
ROGDI-212ENST00000590198 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
ROGDI-212ENST00000590198 FCHSD2O94868 740 aa40.93■■■■■ 4.14
ROGDI-212ENST00000590198 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa40.9■■■■■ 4.14
ROGDI-212ENST00000590198 BTAF1O14981 1849 aa40.89■■■■■ 4.14
ROGDI-212ENST00000590198 AKAP4Q5JQC9 854 aa40.89■■■■■ 4.14
ROGDI-212ENST00000590198 DCAF5Q96JK2 942 aa40.89■■■■■ 4.14
ROGDI-212ENST00000590198 PHACTR3Q96KR7 559 aa40.88■■■■■ 4.13
ROGDI-212ENST00000590198 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa40.87■■■■■ 4.13
ROGDI-212ENST00000590198 GAS2L2Q8NHY3 880 aa40.85■■■■■ 4.13
ROGDI-212ENST00000590198 TMOD3Q9NYL9 352 aa40.83■■■■■ 4.13
ROGDI-212ENST00000590198 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
ROGDI-212ENST00000590198 PIGBQ92521 554 aa40.82■■■■■ 4.13
ROGDI-212ENST00000590198 ERVV-2B6SEH9 535 aa40.81■■■■■ 4.12
ROGDI-212ENST00000590198 TXNRD1Q16881 649 aa40.81■■■■■ 4.12
ROGDI-212ENST00000590198 PROM2Q8N271 834 aa40.81■■■■■ 4.12
ROGDI-212ENST00000590198 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
ROGDI-212ENST00000590198 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa40.8■■■■■ 4.12
ROGDI-212ENST00000590198 ITGB4P16144 1822 aa40.79■■■■■ 4.12
ROGDI-212ENST00000590198 NEFMP07197 916 aa40.78■■■■■ 4.12
ROGDI-212ENST00000590198 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP40.78■■■■■ 4.12
ROGDI-212ENST00000590198 CABP4P57796 275 aa40.77■■■■■ 4.12
ROGDI-212ENST00000590198 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
ROGDI-212ENST00000590198 LGR6Q9HBX8 967 aa40.77■■■■■ 4.12
ROGDI-212ENST00000590198 RREB1Q92766 1687 aa40.76■■■■■ 4.12
ROGDI-212ENST00000590198 GNAT3A8MTJ3 354 aa40.74■■■■■ 4.11
ROGDI-212ENST00000590198 RNMTO43148 476 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
ROGDI-212ENST00000590198 PLEKHF1Q96S99 279 aa40.74■■■■■ 4.11
ROGDI-212ENST00000590198 MAP3K5Q99683 1374 aa40.74■■■■■ 4.11
ROGDI-212ENST00000590198 CCDC184Q52MB2 194 aa40.72■■■■■ 4.11
ROGDI-212ENST00000590198 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
ROGDI-212ENST00000590198 NUP188Q5SRE5 1749 aa40.7■■■■■ 4.11
ROGDI-212ENST00000590198 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa40.7■■■■■ 4.11
ROGDI-212ENST00000590198 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa40.69■■■■■ 4.11
ROGDI-212ENST00000590198 NBPF14Q5TI25 921 aa40.69■■■■■ 4.1
ROGDI-212ENST00000590198 PALLDQ8WX93 1383 aa40.69■■■■■ 4.1
ROGDI-212ENST00000590198 ASAP1Q9ULH1 1129 aa40.68■■■■■ 4.1
ROGDI-212ENST00000590198 ADAMTS8Q9UP79 889 aa40.68■■■■■ 4.1
ROGDI-212ENST00000590198 SCN11AQ9UI33 1791 aa40.68■■■■■ 4.1
ROGDI-212ENST00000590198 SLC27A3Q5K4L6 730 aa40.66■■■■■ 4.1
ROGDI-212ENST00000590198 SLC52A2Q9HAB3 445 aa40.66■■■■■ 4.1
ROGDI-212ENST00000590198 LRRC4BQ9NT99 713 aa40.66■■■■■ 4.1
ROGDI-212ENST00000590198 KCNQ4P56696 695 aa40.65■■■■■ 4.1
ROGDI-212ENST00000590198 IL17REQ8NFR9 667 aa40.65■■■■■ 4.1
ROGDI-212ENST00000590198 ATG3Q9NT62 314 aa40.65■■■■■ 4.1
ROGDI-212ENST00000590198 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
ROGDI-212ENST00000590198 CCDC146Q8IYE0 955 aa40.63■■■■■ 4.09
ROGDI-212ENST00000590198 MRS2Q9HD23 443 aa40.63■■■■■ 4.09
ROGDI-212ENST00000590198 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
ROGDI-212ENST00000590198 LY75O60449 1722 aa40.62■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms